Alla sua nascita aveva un fratello maggiore, Giovanni Giorgio, nato un anno prima di lui e morto ad un anno di età. Erede del ducato divenne quindi Cristiano che salì sul trono alla morte del padre nel 1691.
Il regno di Cristiano II durò solo quattro anni. Come suo padre, ebbe continue controversie ereditarie con i cugini sassoni a causa del testamento di suo nonno Giovanni Giorgio II di Sassonia, che non aveva tenuto conto dei diritti ereditari del suo primogenito ma aveva favorito i figli maschi minori, tra cui il terzogenito Cristiano I.
Cristiano II morì nel 1694 lasciando tre figli maschi. Ereditò il ducato il primogenito Cristiano Maurizio ancora minorenne. Assunse per lui il governo del ducato Federico Augusto I di Sassonia.
A testimonianza del regno di Cristiano rimane un obelisco nel parco del Castello di Mersenburg che ritrae il duca con la moglie Erdmuthe Dorotea.