Insegnò qui dal 1815 e fu successivamente invitato a succedere a Oluf Gerhard Tychsen nella sua cattedra a Rostock, ma preferì andare a San Pietroburgo, dove divenne direttore del Museo Asiatico e consigliere di Stato.
Frähn nel 1817 fu eletto membro ordinario dell'Accademia. Non insegnò a San Pietroburgo, ma alcuni eruditi russi, iranologhi o arabisti, si considerarono suoi allievi perché diede loro delle lezioni private. Vladimir Tizengausen proseguì i suoi studi.
Beiträge zur Muhammedanischen Münzkunde aus St. Petersburg: oder Auswahl seltener und merkwürdiger, bis dahin unbekannter Muhammedanischer Münzen aus dem Kabinet des P. Pflug. Berlino, 1820
Des muhammedanische Münzkabinet des asiatischen Museum der kaiserl. Akademie der Wissenschaf ten zu St Petersburg, 1821
Antiquitatis Muhammedanae monumenta varia , San Pietroburgo, 1820-22, 2 voll.
Ch. M. Fraehnii Recensio numorum Muhammedanorum Academiae imp. scient. Petropolitanae, San Pietroburgo, 1826 (II ed. 1855).
Ibn-Foszlan's und anderer Araber Berichte über die Russen älterer Zeit. Frähn, Christian Martin. - Frankfurt am Main : Inst. for the History of Arab.-Islamic Science, 1994, Reprint of the ed. St. Petersburg 1823 / Institute for the History of Arabic-Islamic Science at the Johann Wolfgang Goethe University Frankfurt am Main
Notice d'une centaine d'ouvrages arabes, lac., qui manquent en grande partie aux bibliothèques de l'Europe, 1834
Ueber alte sued-sibirische Graeberfunde mit Inschriften von gewissem Datum, San Pietroburgo, 1837.
Sammlung kleiner Abhandlungen die muhammedanische Numismatik betreffend, Lipsia, 1839; nuova ediz., San Pietroburgo, 1844
Miscellen aus dem Gebiete der orientalischen Litteratur St. Petersburg, 1840
Indications bibliographiques, San Pietroburgo, 1845
Nova supplementa ad recensionem Num. Muham. Acad. Imp. Sci. Petropolitanae, 1855
Cosmographie de Dimeschky, San Pietroburgo, Impr. de l'Acad. Impér. des Sciences, 1866
La sua descrizione di alcune monete coniate dai signori samanidi e buwaihidi (1804) fu scritta direttamente in arabo perché non aveva in quel momento tipi dell'alfabeto latino.
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