L'Ajax torna a disputare le competizioni europee dopo la squalifica patita nella scorsa stagione, e il cammino nella Coppa UEFA è trionfale: vengono eliminate in successione Örebro, Rot-Weiß Erfurt e Osasuna con sei vittorie in altrettante partite ed un solo gol subito. Il primo pareggio arriva nei quarti contro il Gent, poi è il turno del Genoa in semifinale (vittoria a Genova per 3-2, poi 1-1 ad Amsterdam), prima di giungere alla doppia finale. Questa si gioca contro il Torino: l'andata nella città piemontese finisce 2-2, e in questo modo lo 0-0 all'Olympisch Stadion è sufficiente agli olandesi per conquistare la coppa grazie alla regola dei gol in trasferta. Con questo successo l'Ajax diventa la seconda squadra europea dopo la Juventus ad essersi aggiudicata tutti e tre i maggiori tornei europei di calcio per club.
La stagione si chiude con un altro secondo posto in campionato, sempre alle spalle del PSV, e Dennis Bergkamp è ancora capocannoniere. La squadra di Eindhoven però viene eliminata dai Lancieri negli ottavi della KNVB beker ai tempi supplementari; il cammino nella manifestazione si interrompe però ai quarti, dopo l'incontro col Feyenoord poi vincitore.