En 1985, il publie The Serpent and the Rainbow qui est une étude des pratiques vaudou en Haïti, en particulier le processus de zombification. Ce livre sert de base à Wes Craven pour réaliser le film L'Emprise des ténèbres (The Serpent and the Rainbow) sorti en 1988.
Passage of Darkness: The Ethnobiology of the Haitian Zombie. Robert F. Thompson, Richard E. Schultes. University of North Carolina Press, 1988, (ISBN0-8078-1776-7).
Penan Voice for the Borneo Rain Forest, Western Canada Wilderness, 1990
The Art of Shamanic Healing, Cross Cultural Shamanism Network, 1991
One River: Explorations and Discoveries in the Amazon Rain Forest. New York: Simon & Schuster, 1996, (ISBN0-684-80886-2).
Shadows in the Sun: Travels to Landscapes of Spirit and Desire, 1998, (ISBN1-55963-354-9)
Light at the Edge of the World: A Journey Through the Realm of Vanishing Cultures. National Geographic, 2001, (ISBN0-7922-6474-6).
The Wayfinders: why ancient wisdom matters in the modern world. Toronto: Anansi Press, 2009, (ISBN0-88784-766-8).
Light at the Edge of the World: A Journey Through the Realm of Vanishing Cultures. Vancouver: Douglas & McIntyre, 2009
Grand Canyon: River at Risk. California: Insight Editions/Palace Press, 2009
Into the Silence: The Great War, Mallory and the Conquest of Everest. New York: Alfred A. Knopf, 2011
River Notes: A Natural and Human History of the Colorado, Washington, D.C.: Island Press, 2012, (ISBN1-61091-361-2).
Los guardianes de la sabiduría ancestral. Su importancia en el mundo moderno, Medellín, Colombia: Sílaba Editores, 2015, (ISBN978-958-8794-65-5).
Pour ne pas disparaitre : Pourquoi nous avons besoin de la sagesse ancestrale [« The Wayfinders: why ancient wisdom matters in the modern world »] (trad. de l'anglais), Paris, Albin Michel, , 229 p. (ISBN978-2-226-22142-1)
Les Soldats de l'Everest : Mallory, la Grande Guerre et la conquête de l'Himalaya [« Into the Silence: The Great War, Mallory and the Conquest of Everest »] (trad. de l'anglais), Paris, Les Belles Lettres, , 576 p. (ISBN978-2-251-44563-2)