Viktoria Issakova est née le à Khassaviourt, en république socialiste soviétique autonome du Daghestan[1]. Elle est la fille d'Evgueni Hertzelievitch Issakov, poète, ancien administrateur du FK Anji Makhatchkala, et ancien directeur général du FK Vidnoïe[2],[3]. Dernière née de la famille, elle a un grand frère et une grande sœur[4]. À douze ans, Viktoria déménage avec sa famille à Moscou, car son frère aîné a été pris à l'école moscovite de la réserve olympique[4]. À Moscou, Viktoria est envoyée dans une école spécialisée dans l'apprentissage avancé de l'anglais, car ses parents souhaitaient qu'elle puisse exercer une profession prestigieuse[5].
En 2001, Viktoria Issakova est engagée dans la troupe du Théâtre Pouchkine de Moscou. En 2003, elle obtient le prix Tchaïka pour son rôle de Pannotchka dans le spectacle Vij.
Viktoria Issakova fait ses débuts au cinéma en 1998, en jouant un rôle épisodique dans la série télévisée Tchékhov et Cie, suivi d'un rôle en 2000 dans la série Imperia pod oudarom[4]. À partir de 2002, Viktoria Issakova se produit régulièrement au cinéma. La même année, elle fait la connaissance d'Oleg Moroz, metteur en scène veuf depuis peu, qu'elle épouse un an plus tard.
Viktoria Issakova joue son premier rôle principal au cinéma en 2005 dans la coproduction russo-ukrainienne Tselouiout vsegda ne tekh, et atteint la célébrité un an plus tard grâce à ses rôles dans le film de guerre Okhota na Piraniu (La Chasse aux piranhas) et le drame Trebouïetsia niania (On demande une nounou).
En 2006, Viktoria Issakova est nommée pour le prix de la meilleure actrice de l'année au festival international du film de Chicago pour son rôle de Kira dans le film de Youri Moroz Totchka[6] (Point final).