Après son lancement à New York l'USS Atlanta reste au port jusqu'en pour subir des aménagements et modifications pour rejoindre l'escadre de l'Atlantique Nord, croisant entre le Golfe du Mexique et les Antilles durant deux ans.
Le , il est réaffecté à l'escadron de l'Évolution avec lequel il voyage vers l'Europe et la Méditerranée. Sur le voyage de retour, il effectue une visite d'amitié à la République du Brésil, avant de retourner à New York à la fin de .
Entre février et , il croise de nouveau dans le golfe du Mexique. De mai à , le navire participe à des exercices et des manœuvres, le long de la côte atlantique à Boston et à New York, pour la formation des marins. Entre et , il navigue successivement le long de la côte Est, dans les Antilles, et dans les eaux sud-américaines.
Le , le croiseur est de nouveau transféré à l'escadron de l'Atlantique Nord. Entre et , il est envoyé dans la mer des Caraïbes pour protéger les intérêts américains.
De mars à le navire de guerre participe à la revue navale de Hampton Roads en Virginie puis retourne dans le golfe du Mexique.
Le , l'USS Atlanta est mis hors service à Norfolk, en Virginie. Il reprend le service dès le , en stationnement dans l'Atlantique Nord pour les 17 mois suivants.
Au cours de cette affectation, il dépose le une compagnie de débarquement à Boca del Toro, en Colombie, pour protéger des résidents américains et leurs biens menacés par une révolte politique et l'activité des flibustiers. En , il revient au port de New York pour un retrait du service durant 5 ans.
Deuxième période (1900-1905)
Le , l'USS Atlanta est remis en service à New York, sous le commandement d'E.C. Pendleton. En fin octobre, le navire prend la mer pour rejoindre l'escadre de l'Atlantique sud au large des côtes du Brésil.
En , il est transféré à l'Escadron des Caraïbes. Au cours de ce stationnement il débarque de nouveau des troupes à terre pour protéger les intérêts américains ; d'abord à Saint-Domingue en et ensuite à Portobelo, au Panama.
En 1904 il fait un voyage en Méditerranée et revient en passant par la côte occidentale de l'Afrique et Le Cap. Il arrive à Hampton Roadsle . En , il part à Annapolis, au Maryland, où il est placé en réserve le . À partir du , il participe à la formation des aspirants garde-côtes.
Troisième période (1905-1912)
En , le navire est basé à Norfolk, où il sert de casernement pour les marins de la flottille de torpilleurs jusqu'en 1909. Puis il rejoint Charleston, en Caroline du Sud, où il reprend son service comme navire-casernes.
Le , l'USS Atlanta est relevé de ses fonctions et, un mois plus tard, le , son nom a été rayé de la liste de la marine. Le navire a été vendu à Charleston le à la Frank Rijsdyk's Scheepsslooperij.
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