Thermoplasmata

Thermoplasmata

Classification

Domaine	Archaea
Embranchement	Euryarchaeota

Classe

Thermoplasmata
Reysenbach, 2002[1]

Classification phylogénétique

Position :

• Classe : Thermoplasmata
  • Ordre : Thermoplasmatales
    • Famille : Ferroplasmaceae
      • Genre : Acidiplasma
      • Genre : Ferroplasma
    • Famille : Picrophilaceae
      • Genre : Picrophilus
    • Famille : Thermoplasmataceae
      • Genre : Thermoplasma

Thermoplasmata est une classe d'archées de l'embranchement (phylum) des Euryarchaeota. Ce sont des microorganismes acidophiles dont le développement est optimal à un pH inférieur à 2. Le genre Picrophilus comprend les organismes les plus acidophiles connus, leur développement se poursuivant jusqu'à un pH minimum de 0,06.

Les Thermoplasmata sont le plus souvent également thermophiles et ne possèdent pas de paroi cellulaire ; Picrophilus fait exception sur ce dernier point.

Phylogénie

La taxonomie actuellement acceptée est basée sur la List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2] et le National Center for Biotechnology Information (NCBI)[3]. La phylogénie est basée sur l'analyse de l'ARN ribosomal 16S[4].

Methanomassiliicoccales	Candidatus Methanogranum caenicola Iino et al. 2013 Methanomethylophilus alvi Borrel et al. 2023 Candidatus Methanoplasma termitum Lang et al. 2015 Methanomassiliicoccus Ca. M. intestinalis Borrel et al. 2013 M. luminyensis Dridi et al. 2012
Thermoplasmatales	Thermogymnomonas acidicola Itoh et al. 2007 Thermoplasma T. acidophilum Darland et al. 1970 (type sp.) T. volcanium Segerer et al. 1988 Picrophilus P. oshimae Schleper et al. 1996 (type sp.) P. torridus Zillig et al. 1996 Ferroplasmaceae Acidiplasma A. aeolicum Golyshina et al. 2009 (type sp.) A. cupricumulans (Hawkes et al. 2008) Golyshina et al. 2009 Ferroplasma ?F. acidarmanus ♠ Dopson et al. 2004 ?F. thermophilum ♠ Zhou et al. 2008 F. acidiphilum Golyshina et al. 2000 (type sp.)

Notes:
♠ Souches citées par le National Center for Biotechnology Information (NCBI) mais non répertoriées dans la LPSN.

Notes et références

1. (en) Référence NCBI : Thermoplasmata (taxons inclus)
2. J.P. Euzéby, « Thermoplasmataceae » [archive du 13 juin 2011], List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) (consulté le 20 août 2015)
3. Sayers, « Thermoplasmata », National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database (consulté le 20 août 2015)
4. All-Species Living Tree Project « 16S rRNA-based LTP release 121 (full tree) », Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database (consulté le 20 août 2015)

• (en) T Cavalier-Smith, « The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 52, n^o Pt 1,‎ 2002, p. 7–76 PMID 11837318

• (en) CR Woese, « Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya », Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 87, n^o 12,‎ 1990, p. 4576–4579 (PMCID 54159, Bibcode 1990PNAS...87.4576W) DOI 10.1073/pnas.87.12.4576 PMID 2112744

• (en) AL Reysenbach, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, New York, Springer Verlag, 2001 (ISBN 978-0-387-98771-2), « Class IV. Thermoplasmata class. nov. », p. 169

• (en) Garrity GM, Holt JG, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, New York, Springer Verlag, 2001 (ISBN 978-0-387-98771-2), « Phylum AII. Euryarchaeota phy. nov. », p. 169