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Publications
Dir., Antiromanisme doctrinal et romanité ecclésiale dans le catholicisme posttridentin : XVIe – XXe siècles, Lyon, Laboratoire de recherche historique Rhône-Alpes, coll. « Chrétiens et Sociétés : documents et mémoires » (no 7), , 165 p. (BNF41436481).
La Crise théologico-politique du premier âge baroque : antiromanisme doctrinal, pouvoir pastoral et raison du prince : le Saint-Siège face au prisme français, 1607-1627 (thèse de doctorat en histoire remaniée), Rome, École française de Rome, coll. « Bibliothèque des Écoles françaises d'Athènes et de Rome » (no 340), , 979 p. (ISBN978-2-7283-0842-2).
Entre saint Augustin et saint Thomas : les jansénistes et le refuge thomiste, 1653-1663 : à propos des 1re, 2e et 18e Provinciales (préf. Gérard Ferreyrolles), Paris, Nolin, coll. « Univers Port-Royal » (no 14), , 280 p. (ISBN978-2-910487-38-6).
Raison d'État et raison d'Église : la France et l'Interdit vénitien, 1606-1607 : aspects diplomatiques et doctrinaux, Paris, Honoré Champion, coll. « Bibliothèque d'histoire moderne et contemporaine » (no 31), , 567 p. (ISBN978-2-7453-1820-6).
Dir., Le Pontife et l'Erreur : anti-infaillibilisme catholique et romanité ecclésiale aux temps posttridentins : XVIIe – XXe siècles, Lyon, Laboratoire de recherche historique Rhône-Alpes, coll. « Chrétiens et Sociétés : documents et mémoires » (no 11), , 187 p. (BNF42431811).
Dir., Histoires antiromaines : antiromanisme et critique dans l'historiographie catholique, XVIe – XXe siècles, t. I, Lyon, Laboratoire de recherche historique Rhône-Alpes, coll. « Chrétiens et Sociétés : documents et mémoires » (no 15), , 202 p. (ISBN978-2-9537928-6-7).
La Puissance et la Gloire : l'orthodoxie thomiste au péril du jansénisme, 1663-1724 : le zénith français de la querelle de la grâce (préf. Olivier Chaline), Paris, Nolin, coll. « Univers Port-Royal » (no 20), , 555 p. (ISBN978-2-910487-46-1).
Dir. avec Franz Xaver Bischof(de), Histoires antiromaines : l'antiromanisme dans l'historiographie ecclésiastique catholique, XVIe – XXe siècles, t. II, Lyon, Laboratoire de recherche historique Rhône-Alpes, coll. « Chrétiens et Sociétés : documents et mémoires » (no 23), , 258 p. (ISBN979-10-91592-08-6).
Les Intermittences du temps : lire Alphonse Dupront, Paris, Éditions de l'École des hautes études en sciences sociales, coll. « En temps et lieux » (no 53), , 396 p. (ISBN978-2-7132-2454-6).
Dir., Théologie et érudition de la crise moderniste à Vatican II : autour du Dictionnaire de théologie catholique, Limoges, PULIM, coll. « Histoire : trajectoires », , 377 p. (ISBN978-2-84287-632-6).
Morales du Carême. Essai sur les doctrines du jeûne et de l’abstinence dans le catholicisme latin (XVIIe – XIXe siècle), Paris, Beauchesne, coll "Théologie historique" (n°126), 2018, 568 p.
Thomisme et théologie moderne. L’École de saint Thomas à l’épreuve de la querelle de la grâce (XVIIe – XVIIIe siècles), Paris-Perpignan, Artège Lethielleux, coll "Sed contra", 2018, 794 p.
Prix Auguste-Molinier 1999 de l'École nationale des chartes pour Antiromanisme doctrinal, pouvoir et raison du prince : le prisme du prince (1606-1611)[2].
↑Sous la dir. de Jean-Robert Armogathe et Bruno Neveu, Antiromanisme doctrinal, pouvoir et raison du prince : le prisme du prince (1606-1611) (thèse pour le diplôme d'archiviste paléographe), Paris, École nationale des chartes, .
↑Sous la dir. de Bruno Neveu, La Crise théologico-politique du premier âge baroque : antiromanisme doctrinal, pouvoir pastoral et raison du prince ; le Saint-Siège face au prisme français (1606-1627) (thèse de doctorat en histoire), Paris, École pratique des hautes études, , 1 245 (SUDOC105756342).