Il est l'un des experts français du Conseil international des archives, engagé dans un vaste programme de recherches sur les archives du XXe siècle (archives du communisme, des organisations politiques, du vin et du monde viticole et de la recherche en sciences humaines et sociales).
Il a dirigé la Maison des Sciences de l'Homme (MSH) de Dijon de 2002 à 2012 dont il a été l'un des initiateurs. Il a été également président du réseau national des MSH de 2005 à 2010 .
Il a été décoré de la Légion d’honneur le à la MSH de Dijon[2]. Depuis 2012, il est le coordinateur scientifique du Consortium Archives des Mondes contemporains de la TGIR Huma-Num.
codirection avec Annie Bleton-Ruget, Antifascisme et nation. Les gauches européennes au temps du front populaire, Éditions universitaires de Dijon, 1998, 272 p.
« Où en est l'histoire du temps présent ? » - no 5 (hors série) de Territoires contemporains, Dijon, Eud, 1998. avec Philippe Poirrier, [présentation en ligne].
Le Front populaire en France, Paris, Complexe, coll. « Questions au XXe siècle » (no 90), , 320 p. (ISBN2-87027-628-1).
La Seconde Guerre mondiale à travers les archives du Val-de-Marne, Tome 1 : 1939-1942, Le Cherche Midi éditeur, Paris, 2004, 310 p.
avec Jean Vigreux, Les Combats de la mémoire : La FNDIRP de 1945 à nos jours, Le Cherche Midi, 2006, 332 p., [présentation en ligne].
Pierre Semard, sous la direction de Serge Wolikow ; avec les contributions de Pierre Vincent, Georges Ribeill, Vincent Chambarlhac [et al.], préface de Georges Séguy, Le Cherche Midi, 2007, 289 p.
L'Internationale communiste (1919-1943). Le Komintern ou le rêve déchu du parti mondial de la Révolution, Les Éditions de l'Atelier, Ivry-sur-Seine, 2010, 288 p.
Champagne ! Histoire inattendue., avec Claudine Wolikow, (beau-livre illustré), Les Éditions de l'Atelier, Ivry-sur-Seine, , 289 p.
1936 Le Monde du Front populaire - Le Cherche Midi , 2016.