SCN5A

SCN5A
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2KBI, 2L53, 4DCK, 4DJC, 4JQ0, 4OVN
Identifiants
Aliases	SCN5A
IDs externes	OMIM: 600163 MGI: 98251 HomoloGene: 22738 GeneCards: SCN5A
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 3 humain[1] Locus 3p22.2 Début 38,548,057 bp[1] Fin 38,649,687 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 9 (souris)[2] Locus 9 F3|9 71.33 cM Début 119,312,474 bp[2] Fin 119,408,082 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans apex of heart ventricule gauche auricule droit myocardium of left ventricle ventricule droit cardiac muscle tissue of right atrium testicule gonade secondary oocyte nerf sural Fortement exprimé dans myocardium of ventricle atrium cartilage de Meckel ventricule droit côte épithélium olfactif scapula myocarde valve auriculo-ventriculaire endothelial cell of lymphatic vessel Plus de données d'expression de référence BioGPS n/a
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison de monoxyde d'azote synthétase transmembrane transporter binding protein domain specific binding voltage-gated sodium channel activity involved in AV node cell action potential voltage-gated sodium channel activity involved in bundle of His cell action potential sodium channel activity voltage-gated sodium channel activity involved in SA node cell action potential voltage-gated ion channel activity ion channel activity voltage-gated sodium channel activity involved in Purkinje myocyte action potential liaison protéique ankyrin binding liaison enzymatique fibroblast growth factor binding voltage-gated sodium channel activity involved in cardiac muscle cell action potential scaffold protein binding protein kinase binding ubiquitin protein ligase binding voltage-gated sodium channel activity fixation de la calmoduline Composant cellulaire voltage-gated sodium channel complex integral component of membrane lateral plasma membrane membrane intercalated disc T-tubule intracellulaire surface cellulaire Z discdkac réticulum endoplasmique Cavéole sarcolemma membrane plasmique cytoplasme perinuclear region of cytoplasm axone Processus biologique regulation of atrial cardiac muscle cell membrane repolarization cellular response to calcium ion membrane depolarization during AV node cell action potential regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization membrane depolarization during Purkinje myocyte cell action potential membrane depolarization during bundle of His cell action potential membrane depolarization during action potential cardiac muscle contraction sodium ion transmembrane transport sodium ion transport positive regulation of epithelial cell proliferation SA node cell action potential brainstem development cardiac ventricle development regulation of atrial cardiac muscle cell membrane depolarization membrane depolarization ventricular cardiac muscle cell action potential bundle of His cell action potential cardiac muscle cell action potential involved in contraction regulation of ion transmembrane transport ion transport cerebellum development regulation of heart rate odontogenesis of dentin-containing tooth positive regulation of action potential regulation of cardiac muscle cell contraction telencephalon development AV node cell to bundle of His cell communication transport transmembranaire positive regulation of sodium ion transport membrane depolarization during SA node cell action potential response to denervation involved in regulation of muscle adaptation regulation of sodium ion transmembrane transport AV node cell action potential regulation of heart rate by cardiac conduction membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential neuronal action potential regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization atrial cardiac muscle cell action potential membrane depolarization during atrial cardiac muscle cell action potential cardiac conduction Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 6331 20271 Ensembl ENSG00000183873 ENSMUSG00000032511 UniProt Q14524 Q9JJV9 RefSeq (mRNA) NM_000335 NM_001099404 NM_001099405 NM_001160160 NM_001160161 NM_198056 NM_001354701 NM_001253860 NM_021544 RefSeq (protéine) NP_000326 NP_001092874 NP_001092875 NP_001153632 NP_001153633 NP_932173 NP_001341630 NP_001240789 NP_067519 Localisation (UCSC) Chr 3: 38.55 – 38.65 Mb Chr 9: 119.31 – 119.41 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Le SCN5A est un gène humain codant la sous-unité alpha d'un canal sodique, voltage dépendant, de type V.

Gène

Il est situé sur le chromosome 3 dans la région 3p21[5].

Protéine

Elle est appelée Na(v)1.5 (ou Nav1.5) et est la sous-unité alpha d'un canal sodique, voltage dépendant, de type V. Son activité pourrait être modulée par des phénomènes mécaniques (traction) de la membrane qui le contient[6]. Elle est également régulée par un complexe protéique composé de syntrophines et de dystrophines[7].

Mutation du gène et médecine

Les mutations sur ce gène sont impliquées dans plusieurs maladies cardiaques, et, essentiellement dans les troubles du rythme cardiaque, comme le syndrome du QT long[8], certaines formes de fibrillation auriculaire[9], le syndrome de Brugada[10]. Ils sont également responsable de troubles de la conduction cardiaque comme pour certains blocs sino-auriculaires congénitaux[11]. Ils sont retrouvés dans certains cas de cardiomyopathie dilatée[12].

Dans certaines insuffisances cardiaque, des mutations sur deux gènes, RBM25 et LUC7L3 modifient l'épissage de l'ARN messager du SCN5A et la fonction du canal sodique résultant[13].

Le mécanisme par lequel une mutation conduit à ces maladies différentes quant à leur manifestation n'est pas clair.

Notes et références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000183873 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032511 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Caractéristique du gène sur HGNC
6. Morris CE, Voltage-gated channel mechanosensitivity: fact or friction?, Front Physiol, 2011;2:25
7. Gavillet B, Rougier JS, Domenighetti AAet al. Cardiac sodium channel Nav1.5 is regulated by a multiprotein complex composed of syntrophins and dystrophin, Circ Res, 2006;18:407–414
8. Wang Q, Shen J, Splawski I et al. SCN5A mutations associated with an inherited cardiac arrhythmia, long QT syndrome, Cell, 1995;80:805–811
9. Darbar D, Kannankeril PJ, Donahue BS et al. Cardiac sodium channel (SCN5A) variants associated with atrial fibrillation, Circulation, 2008;117:1927–1935
10. Bezzina C, Veldkamp MW, van Den Berg MP et al. A single Na(+) channel mutation causing both long-QT and Brugada syndromes, Circ Res, 1999;85:1206–1213
11. Benson DW, Wang DW, Dyment M et al. Congenital sick sinus syndrome caused by recessive mutations in the cardiac sodium channel gene (SCN5A), J Clin Invest, 2003;112:1019–1028
12. McNair WP, Ku L, Taylor MR et al. SCN5A mutation associated with dilated cardiomyopathy, conduction disorder, and arrhythmia, Circulation, 2004;110:2163–2167
13. Gao G, Xie A, Huang SC et al. Role of RBM25/LUC7L3 in abnormal cardiac sodium channel splicing regulation in human heart failure, Circulation, 2011;124:1124-1131