L'Évangile selon la Science. La religion à l'épreuve de la connaissance (2003), éditions Robert Laffont.
Les mathématiques à l'aube du XXIe siècle: Des ensembles à la complexité (2004), éd. Belin.
Menteur qui comme Ulysse...: Logique et paradoxes (2007), éd. Belin.
Son essai Perché non possiamo essere cristiani (e meno che mai cattolici) (« Pourquoi nous ne pouvons pas être chrétiens (et encore moins catholiques) », paru en , en est déjà à sa 6e édition. Il a été traduit en français en 2013 aux éditions La Boîte à Pandore.