Normalien (1876), agrégé d'histoire-géographie (1881), il est surveillant général à l'École normale supérieure de 1885 à 1925. Il joue un rôle important dans les célébrations du centenaire de cette école (1895), ainsi que dans le camp dreyfusard aux côtés de son collègue bibliothécaire Lucien Herr.
Par ailleurs, son arrière-petit fils Jules Dupuy a lui-même intégré l'ENS Paris-Saclay en 2019, perdurant l'héritage de son aïeul[1].
Il est également secrétaire général de l'ENS en 1904.
Il est l'auteur d'une biographie d'Évariste Galois, normalien.
Il repose à Vonoge (Suisse). Sur sa tombe figure la mention "Un vieux dreyfusard" (Source: publication de la Société Internationale d'histoire de l'affaire Dreyfus)
Œuvre
La Vie d'Evariste Galois (1896), réédition Jacques Gabay.
Ferretti Federico, 2016, « Geographies of peace and the teaching of internationalism: Marie-Thérèse Maurette and Paul Dupuy in the Geneva International School (1924–1948) », Transactions of the Institute of British Geographers, 41, p. 570–584.
Ferretti Federico, 2021, « Géopolitique de la paix et mondialisation de la guerre : les cours de Paul Dupuy à l’École internationale de Genève (1940-1942) », in : Ginsburger N., Robic M.-C., Tissier J.-L. (dir.), Géographes français en Seconde Guerre mondiale, Paris, Editions de la Sorbonne, p. 203–224.