Dès 1983, Forterre est le premier savant en France à avoir étudié les archéobactéries[4].
En 1988, il devient responsable d'une équipe de recherche à l'Institut de Génétique et de Microbiologie (IGM) à Orsay et dirige des recherches sur les Archaea, le nouveau domaine du vivant découvert en 1977 et renommé en 1990 par Carl Woese.
Il participe à la 11e conférence internationale sur l'origine de la vie, organisée par l'International Society for the Study of the Origin of Life (ISSOL) à Orléans du 7 au 12 juillet 1996[5],[6]. Immédiatement après, il est l'organisateur d'un colloque, tenu à la Fondation des Treilles du 18 au 24 juillet 1996, sur la nature du dernier ancêtre commun à tous les êtres vivants actuels[7].
En 2004, il intègre l'Institut Pasteur en tant que directeur de la microbiologie[11].
Avec Céline Brochier et Simonetta Gribaldo, il co-organise le colloque « LUCA, 10 ans après », tenu du 4 au 9 septembre 2006 à la Fondation des Treilles[12].
Patrick Forterre est particulièrement connu pour ses théories sur l'évolution et ses prises de position sur la reconnaissance des virus en tant qu'êtres vivants à part entière[13],[14]. Le biologiste considère que les virus pourraient représenter les premiers « organismes à ADN »[15],[16],[17].
2013 : Patrick Forterre, « Les virus à nouveau sur le devant de la scène », Biologie Aujourd’hui, Société de biologie, vol. 207, no 3, , p. 153-168DOI10.1051/jbio/2013018
2017 : Mathias Germain, « Entretien avec Patrick Forterre : L'ancêtre commun à tous les êtres vivants était une cellule assez complexe », La Recherche, no 523, , p. 5-8.
↑Patrick Forterre, Louis d'Endecourt, Christophe Malaterre et Marie-Christine Maurel, De l'inerte au vivant : Une enquête scientifique et philosophique, Montreuil, La Ville brûle, coll. « 360 (dirigée par Sylvestre Huet) », , 223 p. (ISBN978-2-36012-030-7, OCLC847564296, présentation en ligne), Les auteurs, « Patrick Forterre », p. 12-15.
↑Mathieu Vidard, « Les origines de la vie sur Terre », dans Dans les secrets du ciel : rencontres avec des savants remarquables, Paris, Grasset, , 282 p. (ISBN978-2246803201).
↑Frank Ryan (trad. Astrid Vabret et Catharine Mason), « Chapitre 15 : À la fin du voyage », dans Virus & hommes, un destin commun ? [« Virolution »], Paris, Le Pommier, coll. « Essais », , 407 p. (ISBN978-2-7465-0512-4).
↑Patrick Forterre, « L'origine du génome », Les Dossiers de La Recherche, no 19 « L'histoire de la vie : Les grandes étapes de l'évolution », , p. 34-38 (ISSN0029-5671).
↑Patrick Forterre (Questions à), « Au commencement était le virus », Les Dossiers de La Recherche, no 19 « L'histoire de la vie : Les grandes étapes de l'évolution », , p. 39-41 (ISSN0029-5671).