fr OpenBabel

Informations
Développé par	l'équipe de développement d'OpenBabel
Dernière version	3.1.1 (8 mai 2020)
Dépôt	github.com/openbabel/openbabel
Écrit en	C++
Système d'exploitation	Microsoft Windows, Linux et macOS
Environnement	Multiplate-forme
Formats lus	Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, MDL Molfile (en), Protein Data Bank (en), FASTA, Alchemy Format (d), Gaussian Cube File (d), CDX Format (en), Crystallographic Information File, Format .xyz, Free Form Fractional format (d) et MCDL format (d)
Formats écrits	Simplified Molecular Input Line Entry Specification, Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, InChIKey (d), MDL Molfile (en), Multilevel Neighborhoods of Atoms format (d), Free Form Fractional format (d), MCDL format (d) et CAChe MolStruct (d)
Langues	Multilingue
Type	Bibliothèque logicielle; Logiciel de chimie (d)
Licence	Licence publique générale GNU version 2 ou ultérieure
Site web	openbabel.sourceforge.net

Le logiciel libre OpenBabel est un système expert principalement utilisé dans des applications de chemo-informatique pour la conversion de fichiers de structures chimiques. Ce logiciel est disponible pour Windows, Unix, et Mac OS. Il est distribué sous licence GNU GPL.

L'objectif du projet scientifique Open Babel est d'offrir aux utilisateurs et aux développeurs un ensemble de programmes et de bibliothèques logicielles multiplate-forme conçu pour la modélisation moléculaire, la chimie et de nombreux domaines connexes, tel que la conversion de format de fichiers et de données.

Historique

OpenBabel et JOELib sont dérivés de la bibliothèque logicielle OELib. OELib était basé sur des concepts issus du programme Babel et de la bibliothèque logicielle Obabel.

Principales fonctionnalités

Système expert de chimie
Interconvertion de nombreux formats de fichiers de données chimiques.
Recherche de sous-structures (basée sur les descripteurs SMARTS)
Calcul d'empreintes binaires
Adaptateur Python
Adaptateur Perl

Notes et références

↑ « Release 3.1.1 », 8 mai 2020 (consulté le 9 mai 2020)

Annexes

Bibliographie

The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006; DOI 10.1021/ci050400b

Articles connexes

Ghemical, un programme de mécanique moléculaire basé sur OpenBabel
JOELib, version Java d'OpenBabel/OELib
XDrawChem, programme de dessin moléculaire 2D basé sur OpenBabel

Liens externes

(en) Site d'OpenBabel
(en) « Accueil du projet OpenBabel », sur SourceForge.net.
(en) E-BABEL Version interactive d'OpenBabel hébergée au Virtual Computational Chemistry Laboratory
(en) Geoff Hutchison, l'un des principaux développeurs du projet, a été interviewé sur le poadcast chemCast Episode 003
(en) Défauts de conception du logiciel OELib

[wikidata-8f299f9af733cfdda6853dee67bd60072cafbf5d-1] « Release 3.1.1 », 8 mai 2020 (consulté le 9 mai 2020)

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