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Il suit ses études primaires et secondaires à Kébili puis Gabès et obtient son baccalauréat en lettres en juin 1980. Par la suite, il poursuit des études supérieures à la faculté des lettres et sciences humaines de l'université de Tunis ; il y obtient une maîtrise d'histoire en juin 1985 et un certificat d'aptitude à la recherche en histoire contemporaine en octobre 1988, tout en enseignant dans l'enseignement secondaire à Kébili.
En plus d'une cinquantaine d'articles publiés en Tunisie, mais aussi à l'étranger, il a publié les ouvrages suivants :
(ar) Mohamed Dhifallah, Comité de la Voix de l'étudiant zitounien (1950-1956), Tunis, Faculté des sciences humaines et sociales de Tunis, .
(ar) Mohamed Dhifallah (préf. Abdeljelil Temimi), Le mouvement étudiant tunisien (1927-1939), Zaghouan, Fondation Temimi pour la recherche scientifique et l'information, .
(ar) Mohamed Dhifallah, Fenêtres sur l'histoire des Nefzaouas, Nabeul, Imprimerie Papyrus, (réimpr. Tunis, MIP, 2008).
(ar) Mohamed Dhifallah (préf. Hassine Raouf Hamza), Amphi et chaire : études sur les étudiants tunisiens des années cinquante aux années soixante-dix, Sfax, Librairie Aladin, .
(ar) Mohamed Dhifallah, Sociétés hydrauliques en Tunisie : Kébili et Zaghouan au XIXe s., Tunis, MIP, .
(ar) Mohamed Dhifallah, Le Mouvement scout tunisien (1916-1965), Tunis, Institut supérieur d'histoire du mouvement national/Institut supérieur de documentation de Tunis, [1].
(ar) Mohamed Dhifallah, Mémoires de Cheikh Hassan Ayadi, Tunis, Fondation Temimi pour la recherche scientifique et l'information, .
(ar) Mohamed Dhifallah, Biographies de militants du mouvement étudiant tunisien (1910-1991), La Manouba, Presses universitaires de La Manouba, [2].
(ar) Mohamed Dhifallah, Salah Ben Youssef : discours et documents divers, 1955-1956, Tunis, Institut supérieur d'histoire de la Tunisie contemporaine, .
(ar) Mohamed Dhifallah et Salem Labiadh, Les étudiants arabes unionistes-progressistes : l'émergence du mouvement unioniste et ses luttes historiques en Tunisie, Tunis, Sotumedias, [3].
(ar) Mohamed Dhifallah, Les temps du mouvement étudiant tunisien (1910-1991), Tunis, Institut supérieur d'histoire de la Tunisie contemporaine, [4].