En 1984, elle commence sa carrière par un poste dans un laboratoire de développement des procédés chimiques du groupe Rhône-Poulenc à Décines[2].
Après une carrière en Recherches et Développement au sein du groupe Rhône Poulenc qui deviendra Aventis puis Sanofi Aventis, elle dirige à partir de 2007 les sites de production de Mourenx et de Sisteron du groupe pharmaceutique Sanofi[3]. Le site de Sisteron est l’un des plus importants de la région PACA dans le domaine de la chimie pharmaceutique. En 2010, ce site fabriquait environ 750 à 800 tonnes par an d’une quinzaine de principes actifs pour médicaments[4]. Malika Haimeur a la responsabilité de près d’un millier de personnes, et gère, entre autres, les achats, les expéditions et la sécurité des sites[2]. Elle est responsable fabrication de principes actifs de médicaments tels que le Plavix[4].
En 2011, elle est promue vice-présidente du secteur recherche et développement du groupe Sanofi. Elle occupe ce poste jusque 2015[5].