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Elle travaille par ailleurs au sein de la direction générale « Personnel et Services » de la Commission européenne à Bruxelles durant un an à partir de 2000.
Vie privée
Mailis Reps est mariée avec Agris Repšs, avocat dont elle use de la forme courte du nom de famille. Le couple a six enfants.
Vie politique
Parcours militant
Elle adhère au Parti du centre d'Estonie (EKE) en 1998 et entre au bureau cinq ans plus tard en tant que secrétaire chargée des relations internationales. C'est à ce titre qu'elle se retrouve impliquée dans la préparation de l'accord de coopération signé en 2004 avec Russie unie et qui provoque une polémique. Elle est élue vice-présidente de l'EKE en 2005.
Fonctions politiques
Le , elle devient ministre de l'Éducation dans la coalition de Siim Kallas, président du Parti de la réforme d'Estonie (ERE), portefeuille qui prend le titre de « ministère de l'Éducation et de la Recherche » à compter du . Élue députée au Riigikogu en mars, Mailis Reps est reconduite le au poste de ministre de l'Éducation et de la Recherche dans la coalition menée par Andrus Ansip.
À la suite des élections législatives de 2007, Ansip exclut l'EKE de sa nouvelle coalition. Elle retourne alors au Riigikogu, où elle occupe la vice-présidence de la commission des Affaires culturelles. Elle conserve cette fonction après les élections de 2011.
Le , elle retrouve son poste de ministre de l'Éducation et la Recherche dans le gouvernement Ratas I puis le conserve dans le gouvernement Ratas II. Elle présente sa démission le [1].