1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour :
Formé au Gimnasia La Plata, c'est avec ce club qu'il fait ses débuts professionnels en 2010.
Boca Juniors
En , Lisandro Magallán est recruté par le Boca Juniors. Le , il marque son premier but avec son nouveau club, lors du Superclásico face au grand rival, le CA River Plate. Un match qui se termine sur le score de 1-1[1].
En 2018, il atteint avec Boca la finale de la Copa Libertadores, finale qu'il perd face au grand club rival de River Plate[2].
Le , Lisandro Magallán est prêté avec option d'achat au Deportivo Alavés[3]. Le il joue son premier match pour Alavés à l'occasion de la huitième journée de la saison 2019-2020 de Liga face à la Real Sociedad. Il est titulaire en défense centrale ce jour-là et son équipe s'incline sur le score de trois buts à zéro[4].
FC Crotone
Le 3 septembre 2020, Lisandro Magallán est à nouveau prêté, cette fois-ci en Italie au FC Crotone[5], qui vient tout juste d'être promu en Serie A. Il joue son premier match pour Crotone le 20 septembre 2020 lors de la première journée de la saison 2020-2021 de Serie A face au Genoa CFC. Il est titularisé et son équipe s'incline par quatre buts à un[6].
RSC Anderlecht
Le 31 août 2021, Lisandro Magallán est prêté par l'Ajax au RSC Anderlecht. Il vient notamment pour compenser l'absence sur blessure de Hannes Delcroix, absent pour de longs mois[7],[8].
Pumas UNAM
Le , Lisandro Magallán rejoint le Mexique afin de s'engager en faveur du Pumas UNAM[9].