Malcolm Ross (2005) inclut les différents groupes de langues timor-alor-pantar dans sa proposition de langues trans-nouvelle-guinée occidentales, une branche occidentale de la famille hypothétique des langues de Trans-Nouvelle-Guinée[1]. Les langues papoues parlées à Timor et dans les îles proches sont clairement apparentées, mais le lien établi par Ross avec des langues de Papouasie est douteux[2]. Haspelmath, Hammarström, Forkel et Bank rejettent cette classification dans le trans-nouvelle-guinée et font du timor-alor-pantar une famille de langues indépendante[3].
