Jonathan Eisen

Jonathan Eisen
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Directeur de thèse
Philip Hanawalt (en)Voir et modifier les données sur Wikidata
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Benjamin Franklin Award (en) ()
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Jonathan Andrew Eisen, né le 31 août 1968[1], est un biologiste évolutionniste américain, travaillant actuellement à l'université de Californie à Davis[2],[3]. Ses recherches académiques portent sur les domaines de la biologie évolutive, de la génomique et de la microbiologie et il est le rédacteur en chef académique de la revue en libre accès PLOS Biology[4],[5],[6],[7],[8].

Éducation

Eisen a terminé ses études de premier cycle au Harvard College en 1990 en obtenant un diplôme en biologie[9]. Il a obtenu son doctorat de l'université Stanford en 1998 avec une thèse sur l'évolution des gènes, des protéines et des processus de réparation de l'ADN en 1998, sous la direction de Philip Hanawalt.

Recherche

Eisen featured in a comic strip by Jorge Cham on the occasion of Open Access Week 2012.

Les recherches d'Eisen[10] se concentrent sur l'origine des nouveautés évolutives, c'est-à-dire comment de nouveaux processus et fonctions naissent dans les êtres vivants. Pour étudier cela, il se concentre sur le séquençage et l'analyse des génomes d'organismes, en particulier des microbes et en utilisant l'analyse phylogénomique.

En 2011, Eisen a reçu le prix Benjamin Franklin (Bioinformatique) pour la promotion du libre accès dans les sciences de la vie[11].

Eisen, avec Nick Barton, Derek EG Briggs, David B. Goldstein et Nipam H. Patel, est l'auteur du manuel de premier cycle, Evolution, qui intègre la biologie moléculaire, la génomique et la génétique humaine aux études évolutives traditionnelles[12]. Selon Google Scholar[10], ses articles évalués par des pairs les plus cités portent sur le séquençage du génome de Plasmodium falciparum[13], séquençage de la mer des Sargasses[14] et un article sur le génome de Thermotoga maritima[15].

Avant de travailler à l'UC Davis, il était chercheur à l'Institute for Genomic Research.

Eisen et son travail sont régulièrement mentionnés dans la presse scientifique et populaire. Les exemples incluent un article du New York Times sur l'Encyclopédie génomique des bactéries et des archées en 2009[16] et une couverture étendue des travaux sur la recherche d'un « quatrième domaine » de la vie[17],[18]. De plus, le travail de blogging et de microblogging d'Eisen est fréquemment repris dans les médias[19],[20],[21]. Son frère, Michael Eisen est également biologiste.

Prix et récompenses

Eisen a reçu le prix Benjamin Franklin (bioinformatique) en 2011 et le prix Best and Brightest du magazine Esquire. Il a reçu le Walter J. Gores Award, Faculty Achievement Awards for Excellence in Teaching. Il a été élu membre de l'American Society for Microbiology (FAAM).

Références

  1. ↑ (en) « These Were a Few of Their Favorite Things », The New York Times,‎ (lire en ligne)
  2. ↑ http://phylogenomics.wordpress.com Web site for the laboratory of Jonathan A. Eisen
  3. ↑ http://phylogenomics.blogspot.com Jonathan Eisen's Blog, The Tree of Life
  4. ↑ Eisen, « PLoS Biology 2.0 », PLOS Biology, vol. 6, no 2,‎ , e48 (PMID 18303952, PMCID 2253640, DOI 10.1371/journal.pbio.0060048)
  5. ↑ « Plenty more bugs in the sea », The Economist,‎ (lire en ligne, consulté le ) article about Jonathan Eisen in The Economist
  6. ↑ « Scopus preview - Eisen, Jonathan A. - Author details - Scopus », sur www.scopus.com (consulté le )
  7. ↑ The Arabidopsis Genome Initiative, « Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana », Nature, vol. 408, no 6814,‎ , p. 796–815 (PMID 11130711, DOI 10.1038/35048692, Bibcode 2000Natur.408..796T)
  8. ↑ Jonathan Eisen: Meet your microbes (TEDMED 2012)
  9. ↑ « Jonathan Eisen » Faculty », UC Davis Genome Center (consulté le )
  10. ↑ a et b « Jonathan A. Eisen », sur scholar.google.com (consulté le )
  11. ↑ Bio-IT World staff, « UC Davis' Jonathan Eisen Wins 2011 Benjamin Franklin Award », Bio-IT World,‎ (lire en ligne, consulté le )
  12. ↑ Nipam H. Patel, Barton, Nicholas John, Derek E. G. Briggs, Eisen, Jonathan et Goldstein, David I., Evolution, Plainview, N.Y, Cold Spring Harbor Laboratory Press, (ISBN 978-0-87969-684-9)
  13. ↑ Gardner, Hall, Fung et White, « Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum », Nature, vol. 419, no 6906,‎ , p. 498–511 (PMID 12368864, PMCID 3836256, DOI 10.1038/nature01097, Bibcode 2002Natur.419..498G)
  14. ↑ Venter, Remington, Heidelberg et Halpern, « Environmental Genome Shotgun Sequencing of the Sargasso Sea », Science, vol. 304, no 5667,‎ , p. 66–74 (PMID 15001713, DOI 10.1126/science.1093857, Bibcode 2004Sci...304...66V)
  15. ↑ Fraser, Clayton, Gill et Gwinn, « Evidence for lateral gene transfer between Archaea and bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima », Nature, vol. 399, no 6734,‎ , p. 323–329 (PMID 10360571, DOI 10.1038/20601, Bibcode 1999Natur.399..323N)
  16. ↑ Zimmer, « Scientists Start a Genomic Catalog of Earth's Abundant Microbes », The New York Times,‎ (lire en ligne)
  17. ↑ « Plenty more bugs in the sea », The Economist,‎ (lire en ligne)
  18. ↑ Dickey Zakaib, « The challenge of microbial diversity: Out on a limb », Nature, vol. 476, no 7358,‎ , p. 20–21 (PMID 21814255, DOI 10.1038/476020a)
  19. ↑ Mandavilli, « Peer review: Trial by Twitter », Nature, vol. 469, no 7330,‎ , p. 286–287 (PMID 21248816, DOI 10.1038/469286a, Bibcode 2011Natur.469..286M)
  20. ↑ « The Scientist Magazine® - Magazines » [archive du ] (consulté le )
  21. ↑ Brumfiel, « Science journalism: Breaking the convention? », Nature, vol. 459, no 7250,‎ , p. 1050–1051 (PMID 19553969, DOI 10.1038/4591050a)

Liens externes