À la mort de leur père en 1516. Joachim et ses frères ainés Jean V et Georges III sont devenus les nouveaux souverains conjoints d'Anhalt-Dessau sous la régence de leur mère pendant les premières années de leur règne. En 1544 les trois frères décident de procéder à une division formelle de leurs possessions patrimoniales. Joachim reçoit Dessau, Lippene, Jeßnitz, Wörlitz et Raguhn désormais comme seul prince. La principauté recréée d'Anhalt-Dessau est plus réduite que la précédente entité de ce nom du fait des divers domaines qui sont attribués à Jean V et Georges III.
Joachim est un prince très actif dans la construction d'édifice et l'organisation de ses domaines il crée ordre une police dans ses États et à Dessau en 1554, il fait réédifier la tour de l'Église de Marie. Joachim est considéré comme un prince solitaire et taciturne mais aussi comme un ami proche Martin Luther, Philippe Melanchthon et Joachim Camerarius l'Ancien. Il meurt célibataire et sans enfant, ses domaines reviennent à ses neveux, fils de son frère Jean V.
Anthony Stokvis, Manuel d'histoire, de généalogie et de chronologie de tous les États du globe, depuis les temps les plus reculés jusqu'à nos jours, préf. H. F. Wijnman, ,éditions BrillLeyde 1890-1893, réédition 1966, volume III, chapitre VIII « Généalogie de la Maison d'Anhalt, I » et tableau généalogique no 126.
(de) Johann Gottfried Gruber, Johann Samuel Ersch: Allgemeine Enzyklopaedie der Wissenschaften und Kuenste in alphabetischer Folge von genannten Schriftstellern. ADEVA, Graz 1975, (ISBN3-201-00093-0), Bd. 5, S. 24 (Nachdr. d. Ausg. Leipzig 1820 ff.; Digitalisat).
(de) Gerhard Heine: Geschichte des Landes Anhalt und seiner Fürsten. Verlag Heine, Köthen 1866, S. 58.