Né dans une famille de marins-pêcheurs de La Chaume, un quartier des Sables-d'Olonne, en Vendée, Jean Huguet est un élève studieux qui obtient d'excellents résultats scolaires. Il revient de sa première campagne de pêche au thon avec deux certitudes: ses parents font un métier hors du commun, dont il sera fier toute sa vie, mais lui, malgré tout le respect et l'admiration qu'il leur porte, ne sera pas pêcheur.
Il commence sa vie professionnelle dans l'enseignement, et entame un parcours d'écrivain, d'historien et d'humaniste.
Devenu libraire à Paris (1949-1954), il est secrétaire national des Libraires (1953-1959) et fonde L'Officiel de la Librairie, publication professionnelle dont il assure la rédaction en chef de 1953 à 1969.
De retour chez lui, à La Chaume, il y crée une maison d'édition : Le Cercle d'Or, qui publie de nombreux ouvrages de littérature et de régionalisme de 1972 à 1989 et il y fonde un groupe de chant choral amateur "les veillées chaumoises" dont le répertoire est fondé sur les chants traditionnels locaux (Partons, la mer est belle…).
Peu d'intellectuels ont su, comme lui, rendre hommage à leurs racines et élever la culture vernaculaire au rang d'un art populaire majeur.
La Mère et l'enfant, précédé de la Lettre à un lycéen, adressée à Jean Giraudoux, suivi des deux premiers chapitres de Charles Blanchard de Charles-Louis Philippe, présentation de Jean Huguet, Club des jeunes amis du livre, 1959
Ellora, 1959
Que ferons-nous de tout cet amour ? Casterman, Coll. L'Éolienne, 1971
Jean Huguet, Un cœur d'étoffe rouge : France et Vendée 1793, le mythe et l'histoire, Paris, Editions R. Laffont, , 272 p. (ISBN2-221-04758-3)
Paul Emile Pajot, marin pêcheur, imagier de la mer, Éditions André Bonne, coll. Univers des hommes, 1975
Robespierre ou la Vérité de la Révolution, 1992
Commentaire de la Guerre Civile, Vendée, 1793-1794 : chronologies, réflexions et récits, Expressions et formes associées/EFA, 1993
Récits :
Si La Chaume m'était contée…Une évocation historique du berceau des Sables-d'Olonne, photographies d'Yvan Tenailleau, Éditions Navarre, 1968
La Chaume, un peuple en fête. La belle et simple histoire des veillées chaumoises, Éditions Le Cercle d'or, 1983.
Nau l'Olonnois ou l'impossible et fabuleux amour du roi de l'Ile de la Tortue, Éditions Le Cercle d'or, 1985
L'An I de la Vendée, Éditions Robert Laffont, 1986, (ISBN2-221050-21-5)
L'Enfant de la mer, Éditions Dominique Balland, 1988 (ISBN2906771066)
Jean Huguet, Florent Colombelle ou l'Orée : Archives de la mémoire sorcière, Luçon (12 rue de l'Aumônerie, 85400, Hécate, , 150 p. (ISBN2-86913-020-1)
La tête pleine d'oiseaux. Francois Servanteau (1744-1795), Expressions et formes associées/EFA, 1994
Autobiographie, journal :
Jean Huguet, L'Année devant l'arbre : chronique, Les Sables-d'Olonne, Éditions le Cercle d'or, , 223 p. (ISBN2-7188-0067-4)
Un témoin de l'Occupation, de la Libération et de la Victoire en Vendée : 1940-1945, Expressions et formes associées/EFA, 1995
Devenir ou des livres plein la tête, 1945-1955, Expressions et formes associées/EFA, 1996
La mer et l'enfant, ou Naître à cet autre monde aujourd'hui oublié : La Chaume, 1925-1937, J. Huguet, 1999
Biographies :
Une journée dans la vie de Paul-Emile Pajot, Le Cercle d'or, 1982
Paul-Emile Pajot, marin-pêcheur et peintre, Le Chasse-Marée, 1989.
(en) Paul-Emile Pajot et Gilbert Pajot, Peintres et pêcheurs : Musée maritime de La Rochelle, 16 juin-15 septembre 1996, Arcueil La Rochelle, Anthèse Musée maritime de La Rochelle, , 95 p. (ISBN2-904420-84-3)