En 1928, le gouvernement des Indes orientales néerlandaises avait créé le Natuurwetenschappelijke Raad voor Nederlandsch-Indië (Conseil scientifique des Indes orientales néerlandaises), qui fut le principal centre de recherche de l'archipel jusqu'à l'occupation japonaise des Indes néerlandaises. Après la fin de la Seconde Guerre mondiale, les Néerlandais revinrent et créèrent, en 1948, L'Organisatie voor Natuurwetenschappelijk Onderzoek (OPIPA, Organisation pour la recherche scientifique). Après la révolution nationale indonésienne, il fut nationalisé et devint le Majelis Ilmu Pengetahuan Indonesia (MIPI, Conseil des sciences indonésien. Puis fut créé en 1962 à côté du MIPI le Departemen Urusan Riset Nasional (DURENAS, Département de la recherche nationale), qui devint en 1966 le Lembaga Riset Nasional (LEMRENAS) (Institut national de recherche). Et en août 1967, fut créé, par le décret présidentiel no 128/1967, le LIPI, fusion du DURENAS et du MIPI[3].