Il est l'auteur d'une Histoire de France en collaboration avec Édouard Charton.
En 1869, avec son confrère Émille Mabille, il est expert paléographe dans le procès du faussaire Denis Vrain-Lucas.
Il est le beau-père d'Ernest Stroehlin et de Théophile Dufour, ainsi que le grand-père de la romancière Noëlle Roger.
Œuvres
Les Archives de la France ou histoire des archives de l'empire, des archives des ministères, des départements, des communes, des hôpitaux, des greffes, des notaires, etc., contenant l'inventaire d'une partie de ces dépôts, Paris, Dumoulin, 1855 ; Genève, 1978
Le Chansonnier huguenot du XVIe siècle, Paris, Librairie Tross, 1870 ; réédition Genève, Slatkine reprints, 1969.
Histoire de France depuis les temps les plus anciens jusqu’à nos jours d’après les documents originaux et les monuments de l’art de chaque époque, en collaboration avec Édouard Charton, 2 tomes, Aux bureaux du Magasin pittoresque, 1859 ; rééditions 1860, 1862, etc.
L'École historique de Jérôme Bolsec, Genève, Charles Schuchardt, 1880
Description des peintures et autres ornements contenus dans les manuscrits grecs de la Bibliothèque nationale, Paris, H. Champion, 1883
Annexes
Bibliographie
Patrick Cabanel, « Henri Léonard Bordier », in Patrick Cabanel et André Encrevé (dir.), Dictionnaire biographique des protestants français de 1787 à nos jours, tome 1 : A-C, Les Éditions de Paris Max Chaleil, Paris, 2015, p. 384-385 (ISBN978-2846211901)
David Gaussen, L'invention de l'histoire nationale en France (1789-1848), Gaussen, 2015 (ISBN978-2356980922)
