Il a été nommé en l'honneur de Hedwige de Ligne (1877-1938) duchesse d'Arenberg. Les rues du polder portent le nom des enfants de la duchesse.
La zone est endiguée avant la guerre de Quatre-Vingts Ans (1568-1648), mais finalement inondée durant celle-ci pour des raisons stratégiques (1584). Au XVIIe siècle, le remblayage est relancé et quelques digues reconstruites. En 1907, ce polder, proche du néerlando-belge Prosperpolder est reconquis sur la mer.
À l'est du Hedwigepolder se trouvait un port à marée dont l'usage ne dura que peu de temps.