Hans Junkermann évolue au niveau professionnel de 1956 à 1973 dans les équipes suivantes : Feru (1955-1958), Faema (1959), Gazzola (1960-1961), Wiel's (1962-1964), Margnat (1965), Torpedo (1966-1967), Batavus (1968-1970), Rokado (1972).
Doté d’un certain talent sur la piste, il détient un très bon palmarès sur les six jours notamment.
En 1972, il est contrôlé positif à un produit interdit pendant le Tour de France[2]. Il arrête sa carrière professionnelle à l’issue de cette saison.