Le club résulte de la fusion en 2002 des sections handball du TSG Balingen et TV Weilstetten. Cette fusion est rapidement bénéfique puisque le HBW Balingen-Weilstetten termine premier du championnat régional (Regionalliga) et est promu en 2. Bundesliga.
Pour sa première saison dans l'antre de l'élite allemande, le club parvient à terminer douzième de la série sud du Championnat sur les 18 participants. Une performance améliorée les saisons suivantes puisque le HBW Balingen-Weilstetten termine septième du championnat en 2005 puis premier de sa poule en 2006, synonyme d'accession en 1. Bundesliga, le meilleur championnat d'Europe.
Le pari est plutôt réussi puisque le club parvient à se maintenir grâce à sa treizième place sur les 18 participants. Les saisons suivantes, les résultats du club restèrent plutôt constants puisqu'il évite chaque saison la relégation en se classant entre les treizième et quinzième place (premier non relégable).
Lors de la saison 2013/2014, le HBW Balingen-Weilstetten termine seizième du championnat avec 19 points et est mathématiquement relégué mais est repêché du fait des importants problèmes économiques du HSV Hambourg qui est relégué en 3.Liga[1]. Si Hambourg est finalement autorisé à évoluer en 1re Division[2], le repêchage du HBW Balingen-Weilstetten n'est pas remis en cause, si bien que la Bundesliga 2014-2015 s'est jouée à 19 clubs.
Lors de la saison 2014/2015, le club réalise son meilleur parcours en Championnat avec une onzième place mais est relégué au terme de la saison 2016/2017 du fait de sa dix-septième place. De retour en 2. Bundesliga, le club termine cinquième en 2018 puis champion en 2019, synonyme de retour dans l'élite.
Le club évolue au Sparkassen-Arena, ayant une capacité de 2320 places mais il évolue parfois à la Porsche-Arena de Stuttgart lors d'importantes rencontres qui peut quant à elle accueillir 6100 personnes.