En 1922, le docteur Arthur Rousseau, doyen de la faculté de médecine de l'Université Laval, obtient l'appui du gouvernement et du diocèse pour la fondation d'un hôpital général pouvant former de futurs médecins[1]. Le chantier s'ouvre à l'été 1924. Les plans sont réalisés par les architectes Morissette et Beaulé[2].
L'hôpital est érigé en 1927 sous la direction des sœurs Augustines. Elles sont rapidement suivies par les sœurs de la Charité en , qui deviennent propriétaire de l'établissement en 1936[3]. En 1931, l'hôpital compte 280 lits, dont 45 sont réservés aux soins des enfants. À l'époque, il est le deuxième hôpital en importance de la ville, après l'hôpital de l'Enfant-Jésus. L'Université Laval y dispense des cours en obstétrique et en pédiatrie à partir des années 1940.
De nos jours, l'hôpital est spécialisée en ophtalmologie et en sénologie. Elle dispose d’une urgence ouverte en tout temps.
En , le retrait d'un crucifix accroché dans le hall de l'hôpital depuis sa fondation suscite la controverse[4]. Le Ministère de la Santé et des Services sociaux demande sa réinstallation, ce qui est fait le .