La plupart de ses travaux concernent la Shoah en général et l'histoire du camp de concentration d'Auschwitz en particulier. Il a établi de la manière la plus rigoureuse possible le nombre de victimes des camps d'Auschwitz-Birkenau. Selon ses études, au moins 1.1 million d'individus y ont trouvé la mort dont 960 000 étaient des Juifs[2],[1].
(pl) Franciszek Piper, Zatrudnienie wiȩżniów KL Auschwitz : Organizacja pracy i metody eksploatacji siły roboczej, Oświȩcim, Państwowe Muzeum w Oświȩcimiu, , 484 p.
(de) Franciszek Piper, Auschwitz, 1940-1945 03, Vernichtung : Studien zur Geschichte des Konzentrations- und Vernichtungslagers Auschwitz, Oświęcim, Verlag des Staatlichen Museums Auschwitz-Birkenau, , 412 p.
(en) Franciszek Piper (trad. William Brand), Auschwitz, 1940-1945 3, mass murder : central issues in the history of the camp, Oświęcim, Auschwitz-Birkenau State Museum, , 282 p. (initialement édité en Pologne en 1995)
(en) Tadeusz Iwaszko, Hélèna Kubica, Franciszek Piper ...[et al.] (trad. William Brand), Auschwitz, 1940-1945 2, The prisonners-their life and work : central issues in the history of the camp, Oświęcim, Auschwitz-Birkenau State Museum, , 452 p. (initialement édité en Pologne en 1995)