Fils d'un pasteur luthérien, il étudia les mathématiques et la médecine jusqu'en 1668, puis, entama des études de droit à Marburg ; il vécut ensuite à Hambourg comme professeur et écrivain. Dans son roman Akademische Roman, worrinnen das Studenleben furgebildet ist, il décrit la vie des étudiants après la guerre de Trente Ans. Il traduisit le Valérius Maximus et écrivit une œuvre historique, dont fait partie le Grosste Denkwurdigkeiten der Welt oder sogennante relationes curiosae, un recueil de culture populaire fantastique et magique.
Œuvres
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Der italienische Spinelli oder so genannte Europäische Geschicht-Romans auf das 1685. Jahr. 4 Bände, 1685–1686
Der spanische Quintana oder so genannte Europäische Geschicht-Roman auf das 1686. Jahr. 4 Bände, 1686–1687
Der französische Cormantin oder so genannte Europäische Geschicht-Roman auf das 1687. Jahr. 4 Bände, 1687–1688
Everhardi Guerneri Happelii Mundus Mirabilis Tripartitus, Oder Wunderbare Welt, in einer kurtzen Cosmographia. 3 Bände, 1687–1689.
Der ottomanische Bajazet oder so genannte Europäische Geschicht-Roman auf das 1688. Jahr. 4 Bände, 1688–1689
Afrikanischer Tarnolast. 1689
Der teutsche Carl oder so genannte Europäische Geschicht-Roman auf das 1689. Jahr. 4 Bände, 1690
Der Academische Roman, worinnen das Studenten-Leben fürgebildet wird. 1690 (Modèle:DTAW); hrsg. G. E. Scholz, Wien 1962 (Repr. d. Ausg. Ulm 1690)
Die nach Happels Tod (1690) veröffentlichten weiteren „Europäischen Geschicht-Romane“ stammen nicht mehr aus seiner Feder.
Rééditions:
Eberhard Werner Happel : Der Insulanische Mandorell (1682). Im Anhang: Pierre-Daniel Huets Traitté de l’origine des romans (1670). Hg. u. mit einem Nachwort versehen v. Stefanie Stockhorst. 687 S., 2 Abb. Berlin 2007 (Bibliothek seltener Texte Bd. 12) [enth. ausführliches Nachwort zu Leben und Werk]
Lebensbeschreibung des Eberhard Werner Happel (1647–1690). Aus dem Roman „Der Teutsche Carl“. Kommentiert von Gustav Könnecke (1908). Mit einem Nachwort von Gerd Meyer. Herausgegeben anlässlich des 300. Todestages. Ergänzter Nachdruck. Kirchhain und Marburg 1990
Gerhard Dünnhaupt(en) : „Eberhard Werner Happel (1647-1690)“, in : Personalbibliographien zu den Drucken des Barock, Bd. 3. Hiersemann, Stuttgart 1991, (ISBN3-7772-9105-6), S. 1952-1968 (Werk- und Literaturverzeichnis)
Uta Egenhoff: Happel, Eberhard Werner. In : Hamburgische Biografie, Band 5, Wallstein, Göttingen 2010, S. 171–173.
Uta Egenhoff : Berufsschriftstellertum und Journalismus in der Frühen Neuzeit. Eberhard Werner Happels ‚Relationes Curiosae‘ im Medienverbund des 17. Jahrhunderts, edition lumière, Bremen 2008 (Presse und Geschichte - Neue Beiträge, 33)
Gustav Könnecke : Eberhard Werner Happel. Marburg 1964
Gerhard Lock : Der höfisch-galante Roman des 17. Jahrhunderts bei Eberhard Werner Happel. Würzburg 1939
Flemming Schock : Die Text-Kunstkammer : populäre Wissenssammlungen des Barock am Beispiel der "Relationes Curiosae" von E. W. Happel. Köln [u.a.] : Böhlau Verlag, 2011 (Beihefte zum Archiv für Kulturgeschichte ; 68). Zugl. : Augsburg, Univ., Diss., 2009. (ISBN978-3-412-20615-4); Rezension : Holger Böning in : Berichte zur Wissenschaftsgeschichte(de). 35 Heft 2, 2012, S. 165f.
Theo Schuwirth : Eberhard Werner Happel (1647-1690), ein Beitrag zur deutschen Literaturgeschichte des 17. Jhs. Diss. Marburg 1908