De 1996 à 2010, Mahncke fut professeur de politique étrangère européenne et d'études de sécurité au Collège d'Europe à Bruges, financé par la Fondation Alfried Krupp von Bohlen und Halbach. Il fut le directeur du département d'études politiques et administratives européennes de 1996 à 2008[2] et le directeur et fondateur du département d'études en relations internationales et diplomatiques de 2006 à 2010[5] du Collège. Il est professeur visiteur au Conseil d'Europe depuis 1975, enseignant tant à Bruges qu'à Natolin (depuis 1996). Il s'est occupé du séminaire de recherche « Maintaining the European Security : Conflict Prevention – Crisis Management – Defence – Arms Control » au Collège d'Europe (Bruges) jusqu'en 2016, date à laquelle il fut remplacé par Antonio Missiroli[2].
(de) Dieter Mahncke, Berlin im geteilten Deutschland, vol. 34, Munich, Vienne, R. Oldenbourg, coll. « Schriften des Forschungsinstituts der Deutschen Gesellschaft für Auswärtige Politik »,
(de) Dieter Mahncke et Hans-Peter Schwarz (préf. Georg Leber), Seemacht und Außenpolitik, vol. 11, Francfort-sur-le-Main, Alfred Metzner, coll. « Reihe Rüstungsbeschränkung und Sicherheit »,
(de) Dieter Mahncke, Vertrauensbildende Maßnahmen als Instrument der Sicherheitspolitik. Ursprung, Entwicklung, Perspektiven, vol. 59, Melle, Ernst Knoth, coll. « Forschungsberichte der Konrad-Adenauer-Stiftung »,
(de) Dieter Mahncke, Konflikt in Südafrika. Die politische Problematik Südafrikas in ihren innen- und außenpolitischen Dimensionen, vol. 12, Paderborn, Munich, Vienne , Zurich, Schöningh, coll. « Studien zur Politik »,
(de) Dieter Mahncke (préf. Gerhard Stoltenberg), Amerikaner in Deutschland. Grundlagen und Bedingungen der transatlantischen Sicherheit, Bonn, Bouvier,
(fr) Dieter Mahncke, « Les paramètres de la sécurité européenne », Cahiers de Chaillot, Paris, Institut des études de sécurité de l'Union de l'Europe occidentale, no 10, (lire en ligne)
(de) Dieter Mahncke, Vertrauensbildende Maßnahmen und europäisches Sicherheitssystem : Von Stockholm 1986 bis Helsinki 1992, Bonn, Konrad-Adenauer-Stiftung,
(en) Dieter Mahncke (préf. Javier Solana de Madariaga), Old Frontiers – New Frontiers. The Challenge of Kosovo and its Implications for the European Union, Berne, Peter Lang, (ISBN978-3-906765-67-9)
(en) Dieter Mahncke, Wayne Thompson et Wyn Rees, Redefining Transatlantic Security Relations : The Challenge of Change, Manchester, Manchester University Press,
(en) Dieter Mahncke, Alicia Ambos et Christopher Reynolds, European Foreign Policy : from Rhetoric to Reality?, vol. 1, Bruxelles, Peter Lang, coll. « Études du Collège d'Europe », (ISBN90-5201-247-4, lire en ligne)
(en) Dieter Mahncke et Jörg Monar, International Terrorism. A European Response to a Global Threat?, vol. 3, Bruxelles, Peter Lang, coll. « Études du Collège d'Europe », , 191 p. (ISBN90-5201-046-3, lire en ligne)
(en) Dieter Mahncke, Europe’s Near Abroad. Promises and Prospects of the EU’s Neighbourhood Policy, vol. 4, Bruxelles, Peter Lang, coll. « Études du Collège d'Europe », , 318 p. (ISBN978-90-5201-047-2, lire en ligne)
(en) Dieter Mahncke (préf. Herman Van Rompuy), European Union Diplomacy. Coherence, Unity and Effectiveness, vol. 15, Bruxelles, Peter Lang, coll. « Études du Collège d'Europe », , 273 p. (ISBN978-90-5201-842-3)
Articles et contributions
(de) Dieter Mahncke, « Was ist Friedensforschung? », Europa-Archiv, no 22, , p. 795-802
(en) Dieter Mahncke, « Europe and the United States », Common Ground, , p. 53-61
(de) Dieter Mahncke, « Alternativen zur nuklearen Abschreckung als Grundlage europäischer Sicherheit? », Aus Politik und Zeitgeschichte, Beilage zu Das Parlament, , p. 3-13
(de) Dieter Mahncke, « Hoffnung ohne Garantie? Diskussion mit Elmar Schmähling », Die Neue Gesellschaft/Frankfurter Hefte, no 2, , p. 150-156
(de) Dieter Mahncke, « Südafrikas Außenpolitik: Gibt es einen Weg aus der Isolation? », Aus Politik und Zeitgeschichte, Beilage zu Das Parlament, , p. 1-9
(en) Dieter Mahncke, « Reunification as an Issue in German Politics 1949-1990 », dans Dieter Grosser, German Unification. The Unexpected Challenge, Oxford, , p. 33-54
(de) Dieter Mahncke, « Innerdeutsche Beziehungen und internationale Rahmenbedingungen: Die Berlin-Krise 1958-1961/62, Gutachten für die Enquete-Kommission des Deutschen Bundestages zur Geschichte und Folgen der SED-Diktatur », dans Deutscher Bundestag, Materialien der Enquete-Kommission, Aufarbeitung von Geschichte und Folgen der SED-Diktatur in Deutschland, Bonn, Berlin, , p. 17-27, 66-71
(en) Dieter Mahncke, « A Rift in Transatlantic Relations: How Serious is the Present Crisis? », Institut d'études européenne, Bruxelles, Université libre de Bruxelles,
(de) Dieter Mahncke, « Post-modern Diplomacy: Can EU Foreign Policy Make a Difference in World Politics? », EU Diplomacy Paper, (lire en ligne)
Autres
(en) Dieter Mahncke, Léonce Bekemans et Robert Picht, The College of Europe. Fifty Years of Service to Europe, Bruges, Collège d'Europe, (ISBN90-804983-1-9)
(en) Dieter Mahncke, Alicia Ambos et Christopher Reynolds, European Foreign Policy : From Rhetoric To Reality?, Peter Lang, , 381 p. (ISBN978-90-5201-247-6, lire en ligne)
(en) Dieter Mahncke et Jörg Monar, International terrorism : a European response to a global threat?, Peter Lang, , 191 p. (ISBN978-90-5201-046-5, lire en ligne)
(en) Dieter Mahncke, « Parameters of European security », Chaillot Paper, Institut d'études de sécurité de l'Union européenne, no 10, (ISSN1017-7566, lire en ligne, consulté le )