|
David SankoffDavid Sankoff
David Sankoff durant la conférence "Models and Algorithms for Genome Evolution", en 2013, Bromont, Québec.
David Sankoff, né le , est un mathématicien, bioinformaticien, informaticien et linguiste canadien. Professeur au département de mathématiques et statistiques de l'Université d'Ottawa, détient la chaire de recherche du Canada en génomique mathématique, tout en étant membre du département de biologie et de l'école des sciences de l'information. Il a lancé la revue scientifique "Language Variation and Change" (Cambridge) et est membre des comités éditoriaux de plusieurs revues scientifiques dans les domaines de la bioinformatique, de la biologie computationnelle et de la linguistique. David Sankoff est reconnu comme un pionnier en linguistique computationnelle et en génomique computationnelle, et comme l'un des pères fondateurs de la bioinformatique. Il a notamment joué un rôle important dans l'introduction de la programmation dynamique[2] pour la résolution de problèmes comme l'alignement de séquences. Il a également été à l’origine des recherches sur le repliement des ARN, la reconstruction phylogénétique, les réarrangements génomiques, et bien des aspects de la génomique comparative. Selon [3], "Michael Waterman and David Sankoff are responsible for transforming bioinformatics from a ‘stamp collection' of ill-defined problems into a rigorous discipline with important biological applications". Carrière académiqueDavid Sankoff a publié son premier article scientifique en 1963[4] alors qu'il était étudiant en mathématiques à l'Université McGill. Dès son doctorat, il a formalisé rigoureusement plusieurs concepts importants en socio-linguistique et en linguistique historique, comme la glottochronologie[5]. Après avoir obtenu son doctorat en mathématiques, David Sankoff a obtenu un premier poste à l'Université de Montréal en 1969. En 1971, il mit au point la première version de l'algorithme de l'algorithme de Needleman-Wunsch ayant une complexité en temps quadratique[6]. En 1973, avec Robert Cedergren, David Sankoff mit au point une méthode d'estimation conjointe d'un alignement de séquences et d'un arbre phylogénétique[7], posant ainsi les bases de la génomique comparative. En 1980, Robert Cedergren et David Sankoff fondèrent le premier groupe de recherche en bioinformatique a l'Université de Montréal[8]. David Sankoff a travaillé sur des problèmes de structure secondaire, réarrangement de génomes, alignement de séquences, évolution des génomes et de phylogénétique[9]. Prix
Références
Liens externes |
