Au titre de professeur de sciences économiques à l'Université Paris IX-Dauphine, il est consultant pour des projets de lois concernant la santé, notamment lors d'une table ronde au Sénat en 2004[6].
Il a été consultant pour l'industrie pharmaceutique.
Claude Le Pen meurt à Paris le 6 avril 2020 à l’âge de 72 ans des suites d'un cancer[7],[8].
Ouvrage
Où va le système de santé français ?, avec André Grimaldi, Prométhée, coll. Pour ou contre ?, Bordeaux, 2010 (ISBN978-2-916623-07-8)
↑ a et bLise Rochaix et Jérôme Wittwer, « La mort de Claude Le Pen, économiste de la santé », Le Monde, no 23407, , p. 21 (lire en ligne)
↑« Coronavirus : « En 2007, la France avait su mettre au point un dispositif de protection très ambitieux contre des pandémies » », Le Monde.fr, (lire en ligne, consulté le )