Par la suite, Cherubino Alberti décore des palais et des églises avec des peintures à fresque. Son œuvre la plus célèbre, réalisée avec son frère Giovanni, est la fresque qui décore la Sala Clementina, au Vatican. Il peint aussi pour l'église Santa Maria in Via Lata.
À sa mort avenue à Rome le , Cherubino Alberti était directeur de l'Académie de Saint-Luc, une association d'artistes de Rome. Il est enterré dans le tombeau familial à l’église Sainte-Marie-du-Peuple à Rome.
La Création, Adam et Ève chassés du Paradis d'après Polidoro da Caravaggio, trois tableaux.
La Mort des enfants de Niobé, cinq tableaux.
L'Enlèvement des Sabines.
Le Triomphe de Camille, dans le style antique.
Pluton tenant une torche.
Fortune debout sur une coquille.
La Présentation au Temple, La Résurrection, et La Sainte Famille, 1582, d'après Raphaël.
Jupiter et Ganymède, d'après Raphaël, 1580.
Les Grâces et Vénus quittant Cérès et Junon, d'après Raphaël.
L'Adoration des mages, 1574, La Transfiguration, le Christ priant sur la montagne, 1574, et la Lapidation d'Étienne, d'après Le Rosso.
Le Baptême de notre Sauveur par saint Jean, 1574, et Le Miracle de saint Philippe Benizzo, d'après Andrea del Sarto.
Tobie et l'Ange, d'après Pellegrino Tibaldi, 1575.
Christ en prière dans le jardin, d'après Perino del Vaga.
L'Adoration des bergers, 1575, La Sainte Famille, La Flagellation du Christ, Conversion de saint Paul, et L'Assomption de la Vierge, d'après Taddeo Zuccari.
L'Assomption et le couronnement de la Vierge, 1572, d'après Federico Zuccari.
Michael Bryan et Robert Edmund Graves, Dictionnaire des peintres et graveurs, Biographique et Critique (Volume I A-K), Londres, George Bell and Sons, (lire en ligne), p. 13.
Ralph N. James, Les peintres et leurs travaux : Dictionnaire de grands artistes méconnus de leur vivant, Londres, L. Upcott Gill, .
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Manescalchi Roberto, Cherubino Alberti la luce incisa, Florence, Grafica European Center of Fine Arts, (ISBN978-88-95450-24-7).