Le , le président José Mário Vaz le limoge avec son gouvernement[2]. Baciro Djá lui succède[3]. Cependant, son gouvernement refuse de céder le pouvoir[4].
En juin 2016, après que son gouvernement a décidé de ne pas quitter le siège du gouvernement au profit du gouvernement Djá, la Justice bissau-guinéenne décide de couper l'eau et l'électricité dans le bâtiment, ainsi que d'interdire l'entrée aux ministres déjà sortis[5]. Le , il quitte le siège du gouvernement avec ses ministres[6].