CXCL13

CXCL13
Visualisation de la protéine Cristallisée CXCL13
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 4ZAI, 5CBA, 5CBE
Identifiants
Aliases	CXCL13, Ligand 13 de la chimiokine, Chimiotactique des lymphocytes B, BLC, Chimiokine 1 attirant les cellules B, BCA-1
IDs externes	OMIM: 605149 MGI: 1888499 HomoloGene: 48431 GeneCards: CXCL13
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 4 humain[1] Locus 4q21.1 Début 77,511,753 bp[1] Fin 77,611,834 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 5 (souris)[2] Locus 5|5 E3 Début 96,104,810 bp[2] Fin 96,108,927 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans rate ganglion lymphatique appendice iléo-cæcal mucosa of ileum epithelium of nasopharynx rectum ligament alvéolo-dentaire tonsille artère temporale superficielle Caduque basale Fortement exprimé dans rate ganglion mésentérique migratory enteric neural crest cell morula glande submandibulaire tunica adventitia of aorta subcutaneous adipose tissue Cellule de Paneth tissu adipeux blanc artère carotide externe Plus de données d'expression de référence BioGPS n/a
Gene Ontology Fonction moléculaire receptor ligand activity CCR10 chemokine receptor binding cytokine activity heparin binding CXCR3 chemokine receptor binding chemokine activity protein heterodimerization activity fibroblast growth factor binding CXCR5 chemokine receptor binding Composant cellulaire région extracellulaire milieu extracellulaire Processus biologique chemokine-mediated signaling pathway positive regulation of cytosolic calcium ion concentration cell-cell signaling germinal center formation regulation of angiogenesis chimiotaxie endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor regulation of humoral immune response cell surface receptor signaling pathway response to lipopolysaccharide regulation of cell population proliferation defense response to bacterium negative regulation of endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor positive regulation of T cell chemotaxis réponse immunitaire réponse inflammatoire inflammation chronique réponse de défense antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide regulation of signaling receptor activity G protein-coupled receptor signaling pathway lymphocyte chemotaxis across high endothelial venule positive regulation of integrin activation positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin B cell chemotaxis activation of GTPase activity neutrophil chemotaxis leukocyte chemotaxis cellular response to lipopolysaccharide Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 10563 55985 Ensembl ENSG00000156234 ENSMUSG00000023078 UniProt O43927 O55038 RefSeq (mRNA) NM_006419 NM_001371558 NM_018866 RefSeq (protéine) NP_006410 NP_001358487 NP_061354 Localisation (UCSC) Chr 4: 77.51 – 77.61 Mb Chr 5: 96.1 – 96.11 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Le ligand 13 de la chimiokine (motif CXC) ou CXCL13, également connu sous le nom de chimiotactique des lymphocytes B (BLC) ou chimiokine 1 attirant les cellules B (BCA-1), est un ligand protéique qui, chez l'humain, est codé par le gène CXCL13[5],[6].

Fonction

CXCL13 est une petite chimiokine appartenant à la famille de chimiokine CXC. Comme ses autres noms le suggèrent, cette chimiokine est sélectivement chimiotactique pour les lymphocytes B appartenant à la fois aux sous-ensembles B-1 et B-2, et provoque ses effets en interagissant avec le récepteur de chimiokine CXCR5[5],[7]. CXCL13 et son récepteur CXCR5 contrôlent l'organisation des lymphocytes B dans les follicules des tissus lymphoïdes[8] et est fortement exprimé dans le foie, la rate, les ganglions lymphatiques et l'intestin des humains[5]. Le gène de CXCL13 est situé sur le chromosome humain 4 dans un groupe d'autres chimiokines CXC[6].

Dans les lymphocytes T, on pense que l'expression de CXCL13 reflète une origine du centre germinatif de la cellule T, en particulier un sous-ensemble de cellules T appelées cellules T auxiliaires B folliculaires (ou cellules TFH). Par conséquent, on pense que l'expression de CXCL13 dans les lymphomes à cellules T, tels que le lymphome à cellules T angio-immunoblastique, reflète une origine du centre germinatif des cellules T néoplasiques[9].

Références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000156234 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023078 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Legler DF, Loetscher M, Roos RS, Clark-Lewis I, Baggiolini M, Moser B, « B cell-attracting chemokine 1, a human CXC chemokine expressed in lymphoid tissues, selectively attracts B lymphocytes via BLR1/CXCR5 », J. Exp. Med., vol. 187, n^o 4,‎ février 1998, p. 655–60 (PMID 9463416, PMCID 2212150, DOI 10.1084/jem.187.4.655)
6. Gunn MD, Ngo VN, Ansel KM, Ekland EH, Cyster JG, Williams LT, « A B-cell-homing chemokine made in lymphoid follicles activates Burkitt's lymphoma receptor-1 », Nature, vol. 391, n^o 6669,‎ février 1998, p. 799–803 (PMID 9486651, DOI 10.1038/35876, S2CID 4373691)
7. Ansel KM, Harris RB, Cyster JG, « CXCL13 is required for B1 cell homing, natural antibody production, and body cavity immunity », Immunity, vol. 16, n^o 1,‎ janvier 2002, p. 67–76 (PMID 11825566, DOI 10.1016/S1074-7613(01)00257-6 )
8. Ansel KM, Ngo VN, Hyman PL, Luther SA, Förster R, Sedgwick JD, Browning JL, Lipp M, Cyster JG, « A chemokine-driven positive feedback loop organizes lymphoid follicles », Nature, vol. 406, n^o 6793,‎ juillet 2000, p. 309–14 (PMID 10917533, DOI 10.1038/35018581, S2CID 4369622)
9. de Leval L, Rickman DS, Thielen C, Reynies A, Huang YL, Delsol G, Lamant L, Leroy K, Brière J, Molina T, Berger F, Gisselbrecht C, Xerri L, Gaulard P, « The gene expression profile of nodal peripheral T-cell lymphoma demonstrates a molecular link between angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL) and follicular helper T (TFH) cells », Blood, vol. 109, n^o 11,‎ juin 2007, p. 4952–63 (PMID 17284527, DOI 10.1182/blood-2006-10-055145 )