Bovan est situé sur les bords de la Sokobanjska Moravica, un affluent droit de la Južna Morava. À la hauteur du village, la rivière reçoit un barrage qui fait partie d'un projet complexe de régulation de la Velika Morava ; elle forme alors le lac artificiel de Bovan. La gorge de Bovan, creusée par la rivière, constitue un but d'excursion pour de nombreux visiteurs.