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Benoît Gillet a été formé au pôle espoir de Dijon où il a joué plusieurs années en championnat de France cadets.
Il commence sa carrière professionnelle à Reims où il joue en première division.
Il joue ensuite à Clermont-Ferrand, passe une année au club de Saint-Étienne, puis rejoint Lille.
Au total, il dispute 124 matchs en Pro A.
Au cours de sa carrière, il est également sélectionné en équipe de France des moins de 20 ans, équipe avec laquelle il dispute le Championnat d'Europe en Turquie durant l'été 2006. Il fait partie des pré-sélections pour les Championnats d'Europe de l'année précédente mais il n'est pas retenu.
En 2014, il signe evec le cub de Denain (Pro B) où il évolue pendant trois saisons.
En 2017, il rejoint le club de Saint-Quentin, club avec lequel il signe à nouveau pour une 6e saison consécutive en juin 2022.
En 2023, à 36 ans, il signe pour deux saisons avec le club Denain (Pro B), club avec lequel il a déjà joué entre 2014 et 2017 [1].