Anssi Karttunen joue aussi bien le violoncelle baroque, classique, moderne, électronique ou le violoncelle piccolo.
Outre son intérêt pour la musique contemporaine, il ne néglige pas pour autant le répertoire traditionnel, comme en témoignent son enregistrement de l'intégrale pour violoncelle de Beethoven sur instruments d'époque, ou son intérêt pour l'époque baroque.
Entre 1994 et 1998, Anssi Karttunen a été directeur artistique de l'Orchestre de Chambre Avanti! à Helsinki et Directeur du Festival Suvisoitto à Porvoo.
Il a été le directeur artistique de la Biennale d'Helsinki (1995 et 1997) ainsi que Musica Nova Helsinki 2015. Entre 1999 et 2005, Karttunen a été violoncelle solo du London Sinfonietta.
Il a créé un trio à cordes, Zebra-trio avec le violoniste Ernst Kovacic et l'altiste Steven Dann. Il joue en duo avec le pianiste Nicolas Hodges et en trio avec le pianiste Florent Boffard et la violoniste Marina Chiche. Il a aussi créé un duo de improvisation électronique, Sons of Chipotle avec le multi-instrumentiste John Paul Jones et le trio Tres Coyotes avec Magnus Lindberg et John Paul Jones.
Depuis 2008, il est le directeur artistique de Creative Dialogue, un atelier de musique contemporaine qu'il a créé avec les compositeurs finlandais Kaija Saariaho et Magnus Lindberg[1].
Robert Schumann: Album for the young, Zebra Trio, Toccata Classics
Hans Werner Henze: Englische Liebeslieder, BBC Symphony, Knussen, WERGO*Toshio Hosokawa: Chant for cello and orchestra, Scottish National Orchestra, Jun Märkl Naxos
Magnus Lindberg: Cello Concerto No 2, Finnish Radio Symphony, Hannu Lintu, Ondine
Colin Matthews: Cello Concerto No 2 NMC Recordings
El Motivo: Tangos, Zebra Trio and guests, Albany Records