Elle aurait été fondée en 675, mais le premier abbé historiquement attesté est Æthelwold de Winchester, au milieu du Xe siècle, qui restaure et agrandit l'abbaye. Abingdon devient ainsi l'un des centres majeurs de la réforme bénédictine anglaise.
Au cours du Moyen Âge, plusieurs personnalités de haut rang sont inhumées à Abingdon, parmi lesquelles :
Le dernier abbé, Thomas Pentecost (ou Rowland), est l'un des premiers abbés anglais à reconnaître l'Acte de suprématie promulgué par le roi Henri VIII : il signe la dissolution de l'abbaye d'Abingdon en 1538.
Les bâtiments de l'abbaye ont presque totalement disparu depuis, et il ne subsiste plus que certaines de ses dépendances. Le site abrite des arches en ruine qui sont en fait de fausses ruines du début du XXe siècle.
Liste des abbés d'Abingdon
La liste traditionnelle des abbés commence par six noms qui sont très vraisemblablement fictifs : Hæha, Cumma, Hræthhun, Alhhard, Cynath et Godescealc.