En 2017, pour se conformer à la législation limitant le cumul des mandats en France, il démissionne de son mandat de maire de Marquillies. Il est remplacé le par Dominique Dhennin[6], tout en restant conseiller municipal de sa commune[7].
Il est spécialiste de la finance mondialisée, de l’évasion et de la fraude fiscale et des paradis fiscaux[10].
De nouveau candidat pour les élections sénatoriales de 2017, aucune banque n'accepte de lui ouvrir un compte de campagne. Des refus qui pourraient s'expliquer par la parution de son livre, Sans domicile fisc, dans lequel il analyse l'évasion fiscale[11]. Il conduit la liste « l'Humain d'abord ! au Cœur de la République » et est réélu le [12].
Il devient secrétaire du Sénat à compter du , fonction qu'il conserve jusqu'au , et il est nommé vice-président de la commission des finances à partir du .
Après l'élection présidentielle de , Éric Bocquet et son frère Alain adressent au nouvel élu, Emmanuel Macron, une lettre demandant de plaider pour « l’idée française d’une COP mondiale de la finance et de la fiscalité sous l’égide de l’ONU », proposition avancée dans leur livre Sans domicile fisc[13].
Réélu sénateur en 2023[1], il démissionne de son mandat en octobre 2024 afin de « passer la main à la génération suivante ». Alexandre Basquin, maire de la commune d’Avesnes-les-Aubert, lui succède[10].
Le , Alain et Eric Bocquet reçoivent de l’association Anticor un Prix Éthique 2018 pour récompenser leur « combat pour l’égalité des citoyens devant l’impôt »[14].
↑Raphaëlle Remande, « Dominique Dhennin remplace l’emblématique Éric Bocquet au poste de maire, « on continue le travail ! » : Dominique Dhennin, très connu à Marquillies pour ses engagements associatifs et ancien deuxième adjoint, a été élu maire par 13 voix sur 19, ce lundi soir. C’est lui qui va avoir la lourde tâche de remplacer Éric Bocquet, élu sénateur. On vous raconte la soirée en moments forts. », La Voix du Nord, (lire en ligne, consulté le )
↑Jean-Charles Gatineau, « Éric Bocquet réélu sénateur: «Je ne vais pas disparaître de mon village» : Réélu sénateur dimanche, Éric Bocquet va devoir quitter son fauteuil de maire pour respecter la loi sur le non-cumul des mandats. Il assure que le nom de son successeur n’est pas encore arrêté alors qu’il restera conseiller municipal, tout en s’occupant de la dette publique. », La Voix du Nord, (lire en ligne, consulté le ).