Le , Alcatraz ferma officiellement ses portes et tous les prisonniers furent transférés hors de l'île. Seulement la vérité est tout autre...
San Francisco, de nos jours. Le lieutenant Rebecca Madsen et le professeur Diego Soto, auteur de bandes dessinées et spécialiste d'Alcatraz, s'associent avec une agence secrète dirigée par Emerson Hauser. Leur mission est de retrouver les 302 prisonniers et gardiens de la célèbre prison qui ont traversé le temps jusqu'à aujourd'hui sans vieillir...
L'agent du FBI Emerson Hauser et sa collaboratrice Lucy Banerjee ouvrent une agence secrète visant à retrouver les disparus d'Alcatraz. Ils embauchent l'inspectrice Rebecca Madsen et traquent Jack Sylvane, un tueur qui faisait partie des détenus disparus et qui a gardé la même apparence physique depuis les années 60. Les trois agents sont rejoints par Diego « Doc » Soto, un expert de la prison d'Alcatraz et auteur de bandes dessinées. Hauser et Madsen essayent d'arrêter Sylvane et de résoudre le mystère d'Alcatraz.
Ernest Cobb est de retour et commet plusieurs meurtres de sang-froid avec un fusil de précision. Madsen, Soto, Hauser et Banerjee sont à ses trousses. Mais Banerjee est sévèrement blessée par un tir du sniper fou et entre dans un profond coma. Il est révélé que la jeune femme était psychologue dans les années 60 à Alcatraz et qu'elle a elle aussi traversé le temps…
Un tueur d'enfants kidnappe ses victimes le vendredi et ramène leur corps le dimanche à leur domicile. Soto en fait une affaire personnelle et réussit à trouver des indices qui ont aidé à la capture du tueur 50 ans plus tôt.
Un braqueur de banques, charmeur mais redoutable, revient dans le présent pour mener un casse en prenant des otages. Madsen et Soto enquêtent sur l'escroc qui laisse de nombreux cadavres derrière lui, un grand changement dans son mode opératoire.
Un gardien de cellule disparu réapparaît. Guy Hastings est un homme bien, mais il se fait repérer après avoir agressé un policier sur l'île d'Alcatraz. Madsen et Soto partent sur sa piste et découvrent le secret de Tommy Madsen.
Un spécialiste de la pose de charges explosives fait son retour et dispose des mines terrestres à travers tout San Francisco. Madsen, Soto et Hauser suivent une série d'indices pour essayer de déterminer le lieu suivant.
Soto reconnaît sur une vidéo Johnny McKee, qui travaille dans un club et qui a fait empoisonner un groupe de personnes. Soto et Madsen se lancent à sa recherche. McKee injecte encore une fois du poison dans l'eau de la piscine où il travaille et plusieurs personnes meurent. Madsen décide d'interroger Jack Sylvane pour en savoir plus sur McKee, et Sylvane lui fait savoir que McKee lui a parlé d'un trou sous les cellules de la prison, mais Hauser l'interrompt et demande qu'on le ramène à sa cellule. Hauser et Madsen enquêtent ensemble sur l'affaire de l'empoisonnement causé par McKee à la piscine et tous les deux craignent qu'il frappe fort à nouveau. Ils retrouvent ensuite son labo, mais il est déjà parti. McKee décide d'empoisonner les passagers d'un métro, mais Madsen et Hauser réussissent à l'arrêter.
Durant les années 1960
Cullen, un autre prisonnier à Alcatraz, demande à McKee de tuer un autre prisonnier et celui-ci commence à élaborer son plan. McKee est placé juste à côté de Jack Sylvane, et il lui raconte l'histoire de la fille sur la photo qu'il porte toujours sur lui. McKee est admis chez le docteur Sengupta qui essaye de discuter avec lui, mais il ne coopère pas. McKee va au cinéma de la prison, là où il compte tuer l'autre prisonnier, mais tue finalement Cullen.
Épisode 8 : Les frères Ames
Titre original
The Ames Bros. (trad. litt. : « Les frères Ames »)
L'un des agents techniques de Hauser, qui faisait des expériences dans les cellules de la prison, est attaqué par Pinky Ames, un prisonnier qui surgit de nulle part. Soto qui était témoin de la scène est surpris par Herman Ames le frère de Pinky et celui-ci l'enferme dans une cellule. Madsen, qui part à la recherche de Soto, rencontre l'officier Archer Donovan, revenu du passé. Ils retrouvent les deux frères, mais il s'est avéré que le gardien est leur complice. Madsen tue Herman et Hauser est touché par une balle, Pinky et Archer s'enfuient. Pinky, qui veut venger la mort de son frère, menace de tuer Soto si Madsen n'accepte pas de se rendre. Madsen accepte mais réussit aussi à tuer Pinky. Archer laisse alors Soto, et fait exploser une porte de la prison. Il espérait trouver l'or caché par James Edwin, mais il ne trouve rien et est arrêté par Madsen. Le docteur Milton et Hauser l'interrogent sur l'officier Ray Archer et le directeur James Edwin.
Durant les années 1960
Pinky, l'un des prisonniers, vole au directeur James Edwin ses clés. Avec l'aide d'une carte de la prison, lui et son frère Herman se rendent dans un tunnel de la prison, ils arrivent à une porte, mais les clés qu'ils ont volées ne sont pas les bonnes et ils sont arrêtés par James Edwin. À la fin de l'épisode, Edwin ouvre la porte et retrouve l'or qu'il a caché.
Hauser refuse la demande de Ray Archer de retirer à Madsen l'affaire des prisonniers d'Alcatraz. Sonny Burnett revient du passé et enlève David Pierce, directeur d'une grande entreprise. Le docteur Milton découvre que le sang des prisonniers revenus du passé contient de l'argent colloïdal et qu'ils guérissent très rapidement, Hauser lui demande alors de transfuser Banerjee avec leur sang, mais aucun d'eux n'a le même groupe sanguin qu'elle. Madsen et Soto interrogent Helen, la femme de David Pierce, et découvrent qu'elle aussi était kidnappée par Burnett quand elle était mineure et a réussi à lui échapper à 14 ans. Burnett les appelle pour récupérer David, mais il l'a déjà tué. Helen avoue qu'après que Burnett a été arrêté, elle lui a volé l'argent qu'il avait caché dans les bois, et c'est pour ça qu'il s'est attaqué à son mari. Madsen et Soto localisent la voiture de Burnett ainsi que la maison où il habite, mais il est déjà parti, et Madsen découvre que la fille d'Helen est sa prochaine cible. Burnett récupère Danielle à l'aéroport. Il essaye de l'enterrer vivante mais elle est sauvée juste à temps et Burnett est arrêté. Burnett a le même groupe sanguin que Lucy, mais son sang ne contient pas d'argent colloïdal.
Durant les années 1960
Burnett termine ses trente jours d'isolation, mais comme il ne peut se protéger des autres prisonniers, il demande alors à Hicks d'assurer sa protection contre l'argent de la dernière rançon. Hicks poignarde Burnett car ses hommes n'ont pas pu trouver l'argent qu'il lui a promis. Burnett est sauvé et commence à s'entraîner pour assurer sa protection tout seul. Le directeur adjoint l'encourage à s'affirmer devant Hicks, quitte à tuer, mais Burnett préférera lui crever les yeux à mains nues.
Clarence Montgomery, l'un des invités à une fête, s'ennuie et sort avec Megan Palmer pour se promener dans un terrain de golf. Quelques instants après, Palmer, la gorge tranchée, est morte et Montgomery change la position de son corps, mais il ne se rappelle rien de ce qui s'est passé. Soto apprend le meurtre de Palmer et remarque qu'il est en parfaite ressemblance avec un autre meurtre commis en 1958. Montgomery retourne ensuite chez un ancien détenu d'Alcatraz, Emmet Little, qui le savait innocent en 1958. Après l'autopsie, Nikki leur précise que le meurtre commis en 1958 et celui de Palmer sont commis par deux personnes différentes, et que le meurtrier de Palmer est atteint de la maladie de Wilson, dont Montgomery a les médicaments. Hauser veut alors leur enlever le cas, mais il leur donne 12 heures pour enquêter. Montgomery est encore invité à une autre fête et, le lendemain, la police découvre le corps d'une autre femme tuée de la même manière que Megan Palmer. Madsen découvre qu'il faisait partie des cuisiniers pour la fête, mais Montgomery réussit à s'enfuir. Madsen décide de le pister par l'ordonnance de ses médicaments et découvre que c'est Little qui lui en achète. Hauser et Madsen débarquent chez Emmit, mais celui-ci les attaque et refuse de les laisser prendre son ami. Montgomery, qui est maintenant conscient de son état, demande à son ami de le tuer et Emmit accomplit son souhait.
Durant les années 1960
Montgomery est un très bon cuisinier et le directeur de la prison, Edwin James, lui propose de préparer un repas pour les prisonniers. Montgomery hésite parce qu'il ne voulait pas faire en sorte que les blancs mangent de sa cuisine. Il rencontre ensuite le Dr Lucille Banerjee et insiste sur le fait qu'il est innocent et que les blancs font toujours ce qu'ils veulent. Montgomery accepte l'offre d'Edwin et une bagarre se déclenche entre les blancs et les noirs. Le docteur Milton pratique une expérience sur lui à base d'images et d'électrochocs. Plus tard, Montgomery tue un autre prisonnier blanc. Montgomery rencontre encore une fois docteur Banerjee et il insiste toujours sur son innocence pour le meurtre de 1958, mais il reconnaît tout de même le meurtre de l'autre prisonnier. Milton et Edwin savent depuis le début que Montgomery est innocent et l'expérience de Milton avait pour objectif d'en faire un meurtrier.
Commentaires
La diffusion de cet épisode était à l’origine prévue pour le 27 février 2012, mais en raison du mauvais temps observé lors du Daytona 500 de 2012, celui-ci a été reporté au 12 mars.[réf. souhaitée]
Une jeune musicienne est retrouvée morte noyée et ses cheveux coupés. Madsen, lassée de rechercher les ex-détenus d'Alcatraz, va sur l'affaire et retrouve du sang mêlé à de l'argent colloïdal. Hauser comprend qu'il s'agit d'un des détenus et veut le criminel vivant car son sang pourrait sauver le docteur Sengupta du coma. Le détenu est Webb Porter, devenu violoniste émérite qui recherche le son parfait en utilisant les cheveux de ses victimes pour son archet. La deuxième victime permet d'identifier le tueur : Webb Porter, le seul violoniste de la prison. Ils retrouvent sa trace vers la sale de concerts où Porter cherchait à se faire embaucher comme musicien. Porter est capturé et amené auprès du Dr Sengupta, et grâce à son sang, elle sort du coma. Pendant ce temps, Soto visionne les enregistrements de 1963 et découvre que Lucy était l'une des disparues de 1963.
1960
Le Dr Sengupta rencontre Webb Porter, un détenu au comportement étrange et mis en isolement. Elle comprend que depuis que sa mère a tenté de le noyer à l'âge de 6 ans, il souffre d'acouphènes et cherche un moyen de les apaiser. Après des séances d'écoute musicale, Sengupta propose à Porter de se choisir un instrument, et prend le violon, qu'il parvient à maîtriser très rapidement. Grâce à cela, il est réintégré dans le quartier collectif, où son jeu fait sensation.
Soto et Rebecca se rapprochent d'un homme qui pourrait enfin révéler les secrets de la prison d'Alcatraz. Pendant ce temps, Hauser découvre quelque chose derrière les murs d'Alcatraz qui pourrait enfin faire connaître la vérité.
Rebecca retrouve l'homme qui a tué son partenaire, son propre grand-père. À travers sa poursuite, Soto et Hauser vont découvrir peu à peu les desseins du directeur James.