Hallazgos arqueológicos han demostrado que Shinusa fue habitada desde tiempos remotos, antes del 2000 a. C. Debido a la abundancia de cerámica, la isla que convierte en un importante mercado donde se desarrollaban las grandes actividades comerciales durante el dominio bizantino. Desde finales del siglo XI, la isla pasó a ser propiedad sel Monasterio Chozoviotissa (Παναγία Χοζοβιώτισσα) de Amorgós.
Con el Protocolo de Londres de 1829, tanto Shinusa como el resto de las Cícladas pasaron a ser parte del emergente estado griego. A mediados del siglo XVIII, colonos provenientes de Amorgós se asentaron en la isla, aunque a mediados del siglo siguiente, muchos de ellos se marcharon a Atenas.
siglo XX
Durante la Segunda Guerra Mundial, la isla estuvo ocupada por Italia desde 1941 hasta 1943, y más tarde pasó a estar bajo dominio alemán. Dada la mala situación de la isla durante la guerra, muchas personas se vieron obligadas a dejar la isla.
La isla en la actualidad
Aunque la red de transporte sigue causando problemas, la mejora de las instalaciones educativas y el surgimiento del turismo han contribuido a que las familias jóvenes hayan elegido la isla como lugar para asentarse o como segunda residencia.
Demografía
Las isla cuenta con dos asentamientos, Chora (O Hora, es decir, la capital de la isla) y Messariá. Antiguamente, la isla tenía muchos problemas con los piratas. Dada esta situación, los habitantes fundaron la ciudad de Panagiá, en lo alto de la colina para poder avistar a los piratas desde el interior. Las casas están construidas con elementos de la arquitectura cicládica.
Chora
La ciudad está construida sobre una colina en el interior de la isla, a 1,2 kilómetros del puerto.
Messariá
La ciudad está construida en torno a la Iglesia de Evangelistria y está a 1,6 kilómetros de Chora. Los habitantes de Messariá subsisten principalmente de la agricultura, de la ganadería, de la pesca y del turismo.
Turismo
La mayoría de viajeros que llegan a la isla van en busca de un lugar apartado donde pasar las vacaciones. La infraestructura para los turistas no está muy desarrollada, pero hay alojamiento suficiente para los turistas que llegan a la isla. La belleza natural de la isla es parte del atractivo turístico en detrimento del resto de Cícladas Menores. La isla cuenta con un total de 15 playas, entre las que están las de Merini, Tsingoura, Livadi, Liolio, Psilí Ammo o Almyró.
La cercanía con Santorini hace que haya muy buenas vistas desde la isla. Los entretenimientos de la isla no son demasiados, simplemente ir a la playa o pasear viendo el Mar Egeo.
En Chora hay un museo de folclore, además de bares y tabernas donde degustar comida típica griega. No es una isla de excesivas compras, aunque se puede encontrar miel de la zona, vino y jamón. No hay autobuses ni taxis, y a veces se pueden encontrar «burrotaxis» para desplazarse.
Iglesias
En Shinusa se sitúa la Sagrada Catedral de Amorgós, Santorini y Shinusa.