En 1992, la Ópera Estatal de Berlín invitó a Jacobs a dirigir Cleopatra e Cesare de Karl Heinrich Graun, para conmemorar el 250 aniversario de esta obra y de la ópera de Berlín.
En 1991, Jacobs fue nombrado director artístico de los programas de ópera de los Festwochen der Alten Musik en Innsbruck. También enseña interpretación y canto barroco en la Schola Cantorum Basiliensis.
En 2011, ha recibido el III Premio Traetta 2011 por parte de la Traetta Society por su labor y su pasión en el redescubrimiento del patrimonio musical europeo.