También fue catedrático de órgano del Conservatorio Superior de Sevilla entre 1979 y 2002; y organista del Hospital de los Venerables, sede de la Fundación Focus.[1][4] Como intérprete ofreció conciertos de órgano en 62 países, tanto en Europa como en América y Ásia.[1]
Falleció en la ciudad de Sevilla tras sufrir un derrame cerebral.[1]
Manuel Castillo: Obra Para órgano. José Enrique Ayarra y el grupo de metales de la Real Orquesta Filarmónica de Sevilla (3 CD). Incluye las siguientes piezas: Suite para órgano (1956), Elevación (1957), Hi Accipient. Fantasía sobre un tema gregoriano (1960), Fantasía para un libro de órgano (1972), Preludio, Tiento y Chacona (1972), Diferencias para órgano sobre un tema de Manuel de Falla (1976), Cuatro cuadros de Murillo (1982), Variaciones sobre un tema de Almandoz (1990), Sinfonía para órgano (1991), Retablos de los Venerables - Ocho meditaciones para órgano (1993), Modo Antiquo (1994), Concierto sacro hispalense para órgano, metales y timbales (1997).
500 años de música de órgano en la Catedral de Sevilla (2 CD).
Premio Andalucía de la Música en 1990, por su labor investigadora, docente, de conservación y difusión del Patrimonio Musical Andaluz, especialmente el repertorio organístico histórico y contemporáneo, como su proyección internacional.[6]