Era hijo del capitán de navío José Javier Ezquerra Guirior, un tudelano miembro de la nobleza navarra que falleció cuando Joaquín tenía ocho años al explotar el navío que mandaba en el asedio de Tarifa (1801), y de la zamorana Ana María del Bayo, señora de Lavoa. Al fallecer su padre Carlos IV nombró a Joaquín caballero paje del rey y cursó estudios durante ocho años con los Escolapios de Zaragoza, donde obtuvo calificaciones excelentes y se mostró especialmente atraído por las matemáticas, las ciencias naturales y el idioma francés.
Como se declaró afrancesado, en 1810 marchó a Francia con la secretaría josefina y allí estuvo viviendo hasta 1822, asociado a la familia del secretario del efímero rey José Napoleón I. A su regreso ingresó en la Escuela de Ingenieros de Caminos y Canales el 19 de junio de 1821 y obtuvo el título de auxiliar del Cuerpo de Caminos y Canales, pero la Escuela fue cerrada por Fernando VII en 1823 y fue desterrado durante un año, que aprovechó para estudiar dibujo y pintura en el estudio de Vicente López.
Fue después inspector general del Cuerpo de Ingenieros de Minas y profesor de Laboreo de Minas y de Mecánica Aplicada en la Escuela Especial del mismo cuerpo, cátedra que desempeñó hasta 1844, porque después de este año estará inmerso en continuas comisiones de servicio para confección de planos y estudios mineros y geognósticos; sobre esta materia escribirá el primer manual en España. Fue además de miembro de diversas sociedades científicas (la Societé Geologique de France, la Geological Society of London, la Sociedad Económica del Gran Ducado de Baden, de la de Madrid y de la de Tudela) y autor de obras y de trabajos industriales importantes. Como fruto de su estancia en Alemania publicó un libro de viajes en 1847 que ilustró él mismo y contiene también observaciones científicas y tecnológicas.
Tradujo los Elementos de geología de Charles Lyell (Madrid: Imprenta de Antonio Yenes, 1847) con adiciones sobre la geología de España y publicó numerosos trabajos, informes y libros sobre geología en varios idiomas. Fue, además, uno de los coordinadores y directores de la Comisión del Mapa Geológico de España, director a los 33 años de una fábrica de vidrio en Aranjuez (1826-1827) y profesor ayudante de Antonio Gutiérrez en la cátedra de física del Conservatorio de Artes (actual Escuela de Ingenieros Industriales), cátedra que asumirá entre 1839 y 1840.
En 1837 ya había sido nombrado miembro de la Real Academia de Ciencias Naturales de Madrid. Ya reconocido geólogo, se le encargó en 1851 visitar los establecimientos mineros del norte de Europa (Bélgica, Noruega, Suecia), sobre lo cual escribió e imprimió luego otro libro de viajes. Intervino además confeccionando por orden de la Dirección General de Minas los mapas de las minas nacionales de Riotinto (1828)[2] y luego por Real Orden en el proyecto de conducción de aguas a Madrid desde los ríos Lozoya y Guadalix (1829).
Minas de carbón de piedra de Asturias. 1831. Junto con Bauza, Amar de la Torre y García.
Elementos de laboreo de minas precedidos de algunas nociones sobre geognosia y la descripción de varios criaderos minerales, tanto de España como de otros reinos de Europa. Se trata de su obra más importante, de la que se hicieron dos ediciones en Madrid, una en 1839 y otra en 1851.Se considera el primer libro moderno de tecnología minera escrito por un autor español.[6] Ambas ediciones incluyen un atlas, la primera de 13 láminas y la segunda de 16 láminas. Entre las láminas del segundo tomo se encuentra una en la que aparece el arco de unión entre la veta de San Nicolás y la de San Francisco, en la mina de Almadén, una importante obra de ingeniería minera de la época. En 1847 se llevó a cabo una edición copia de la primera, sin conocimiento ni autorización del autor, impresa en la Imprenta de Los Tribunales, Santiago de Chile. En esta edición se utilizó la ortografía chilena oficial de la época, que había sido propuesta por Juan García del Río y Andrés Bello. Las láminas se redibujaron y regrabaron de nuevo, casi idénticas a las originales[7]
Datos y observaciones sobre la industria minera, con una descripción característica de los minerales útiles, Madrid: Antonio Yenes, 1844. En este libro se describen distintas minas de Sajonia, así como de Sierra Almagrera (Almería), especialmente las situadas sobre el filón Jaroso.
Viage científico y pintoresco a los diferentes estados de Alemania t. 1, Que comprende el Salzburgo, el Tirol y parte del gran Ducado de Baden, Madrid: Viuda de Antonio Yenes, 1847. Solamente se publicó un tomo, y está destinado a la descripción de minas fábricas, salinas y colecciones mineralógicas de esa zona.
Sobre el estado actual y marcha progressiva de las minas del Barranco Jaroso en Sierra-Almagrera. Imprenta de A. Yenes, Madrid, 1850.
Ensayo de una descripción general de la estructura geológica del terreno de España en la Península [s.l.] : [s.n.], 1850-1857.
Memorias sobre las minas nacionales de Rio-Tinto, Madrid: Imprenta de la viuda de Don Antonio Yenes, 1852. Incluye una gran lámina del terreno de las minas.
Viaje por el Norte de Europa hasta Suecia y Noruega. Madrid, 1857. Se trata de un viaje de estudio de minas y de establecimientos metalúrgicos verificado por real orden.
También publicó una traducción de la obra de Charles Lyell, Elementos de geología, Madrid: Imprenta de Antonio Yenes, 1847.
Otras publicaciones científicas
Publicadas como artículos en el Boletín Oficial de Minas, en los Anales de Minas, en la Revista Minera y en otras revistas[8]
Indicaciones geognósticas sobre las formaciones terciarias del Centro de España
Apuntes geognósticos y mineros sobre una parte del Mediodía de España
↑Antonio Echarri, "Contribución al estudio de la escuela geológico-minera española del siglo XIX: datos bibliográficos de Joaquín Ezquerra y del Bayo (1793-1859)", en Actas II Congreso de la Sociedad Española de Historia de las Ciencias: Jaca, 27 de Septiembre- 1 de Octubre, 1982 coord. por Mariano Hormigón Blánquez Árbol académico, Vol. 2, 1984 (La ciencia y la técnica en España entre 1850 y 1936: comunicaciones), págs. 79-80 https://dialnet.unirioja.es/descarga/articulo/587102.pdf
↑Antonio Couceiro Freijomil, «Ezquerra del Bayo, Joaquín», en Diccionario Bio-bibliográfico de Escritores, 1951, p. 402
↑ abMaffei, E. y Rúa, R. (1871). Apuntes para una Biblioteca Española de libros, folletos y artículos, impresos y manuscritos, relativos al conocimiento y explotación de las riquezas minerales y á las ciencias auxiliares. Imprenta de J.M. Lapuente, Madrid. p. Tomo 1, 221-226.
↑Calvo Rebollar, Miguel (2016). «Los "Elementos de Laboreo de Minas" de Ezquerra del Bayo: Un caso de "piratería editorial" en la primera mitad del siglo XIX». Revista de Minerales, 2016-2, 76-78.
↑Amar de la Torre, Rafael (1859). «Biografía del Ilmo. Sr. D. joaquín Ezquerra del Bayo, Inspector general de minas». Revista Minera, 10, 552-558.