Fabian Wegmann (Münster, 20 de junio de 1980) es un exciclistaalemán. Mide 1,78 m, pesa 60 kg y vive actualmente en Friburgo.
Ha participado en el Tour de Francia 2004 y Tour de Francia 2005. En el Tour de Francia 2005 destacó en la 7.ª etapa con una escapada en solitario de 160 km antes de ser neutralizado por el pelotón a 23 km de meta. Consiguió así el maillot de la montaña, ya que obtuvo todos los puntos durante la escapada.
Pasa al profesionalismo al año siguiente con el equipo Gerolsteiner. En 2003, ganó el Sachsen-Tour. En 2004, participó en las tres clásicas de las árdenas, Amstel Gold Race, Flecha Valona y Lieja-Bastogne-Lieja, las cuales fueron ganadas por su compañero de equipo Davide Rebellin, primer corredor en hacer el triplete. Wegmann disputó enseguida su primera gran vuelta, el Giro de Italia, donde ganó la clasificación de la montaña. En julio, formó parte del equipo que corrió en el Tour de Francia. En 2007 y 2008, se convirtió en campeón de Alemania
El equipo Milram desapareció al final de la temporada 2010. Fabian Wegmann fichó por el equipo Leopard-Trek, creado alrededor de los hermanos Andy y Fränk Schleck. Formó parte del equipo que disputó el Giro de Italia, pero se retiró junto con el resto de sus compañeros en la cuarta etapa debido a la muerte de su compañero Wouter Weylandt durante la tercera etapa.