Se considera que 1889 es el año de inauguración de la estación de ferrocarril. El edificio de la estación, diseñado por Alekséi Dushkin en 1956, fue reconstruido a principios del siglo XXI, convirtiéndose en la principal estación de ferrocarril del sistema del ferrocarril del Cáucaso Norte, formado en 1918 tras la nacionalización de los ferrocarriles privados de Armavir a Tuapsé y el de Vladikavkaz.
De la estación ferroviaria de la estación Krasnodar-I es posible viajar a cualquier región de Rusia y del extranjero cercano (Bielorrusia, Ucrania, Abjasia). En cuanto al servicio local, desde la estación se puede viajar las localidades cercanas del krai y a ciudades de las regiones vecinas, como Rostov del Don (óblast de Rostov) o Mineralnye Vody (krai de Stávropol).