El territorio de El Pego quedó adscrito a la Orden de San Juan en 1116 por cesión de la reina Urraca I de León,[4] permaneciendo posteriormente bajo dominio de la orden sanjuanista.[5]
Ya en la Edad Moderna, la iglesia fue construida en 1782 y convertida en parroquia de la orden de Orden de San Juan de Jerusalén, con dependencia de la encomienda de La Bóveda de Toro. Por otro lado, en estos años El Pego era una de las localidades integradas en la provincia de Toro de cara al voto en Cortes,[6] en la que se mantuvo hasta la desaparición de ésta a inicios del siglo XIX. Finalmente, con la creación de las actuales provincias en 1833, El Pego pasó a formar parte de la provincia de Zamora, manteniendo su adscripción regional al Reino de León.[7]
PEGO (el): l. con ayunt. en la prov. de Zamora (5 leg.) part. jud. de Fuentesauco (2), dióc. nullius, encomienda de San Juan de Jerusalen, aud. terr. y c. g. de Valladolid (13): sit. en un cerro, su clima es templado, sus enfermedades mas comunes las tercianas. Tiene 48 casas, la consistorial y cárcel; escuela de primeras letras dotada con 800 rs., á que asisten 20 niños; igl. parr. (San Clemente), servida por un cura de provision de la encomienda de San Juan, y buenas aguas potables. Confina con Venialbo, la Bóveda y deh. de San Vazan. El terreno es de mediana calidad. Los caminos trasversales: recibe la correspondencia de Fuentesauco. prod.: vino, trigo, centeno y pastos; cria ganados, y caza de liebres y perdices. pobl.: 49 vec., 227 alm. cap. prod.: 130,512 rs. imp. 14,674. contr. 3,960 rs. y 33 mrs.
En 1950 fue cuando alcanzó su máximo esplendor, llegando a contar con 940 habitantes.
Patrimonio
Iglesia parroquial de San Clemente. De construcción nueva, se encuentra en una plaza amplia, con árboles, fuente de piedra y bancos configurando un entorno que incita al paseo. Del interior destaca la imagen barroca de La Inmaculada -de 1,10 m de altura- situada sobre el altar mayor y datada en el siglo XVII.
Casas construidas en el siglo XIX junto a restos de la arquitectura tradicional.
Fiestas
Nuestra Señora de la Tramposa o Natividad de Nuestra Señora, el 8 de septiembre.
Fiestas de verano en las cuales hay toros (por el campo y las calles), verbenas, juegos para mayores y pequeños, además de oficios religiosos.
Día de las Candelas, el 2 de febrero, en la que los quintos y quintas del pueblo recitan las relaciones ante el pueblo y el gallo que se supone que es el juez.
San Clemente, el 23 de noviembre, patrón del pueblo.