Depsipéptido

Un depsipéptido es un péptido en el que uno o más de sus grupos amida, -C(O)NHR-, han sido reemplazados por el correspondiente grupo éster, -C(O)OR,[1]​ Muchos depsipéptidos presentan tanto uniones peptídicas como tipo éster. Se encuentran mayoritariamente en productos naturales de origen marino y microbiano.[2]​

Ejemplo de un depsipéptido con 3 grupos amida (resaltados en azul) y un grupo éster (resaltado en verde). R^1 y R^3 son grupos orgánicos (e. g. metilo) o un átomo de hidrógeno de los encontrados en ácidos α-hidroxicarboxílicos. R^2, R^4 y R^5 son grupos orgánicos o un átomo de hidrógeno de los encontrados en aminoácidos comunes.

Productos naturales depsipeptídicos

La enteroquelina es un depsipéptido transportador de hierro.[3]​

Se ha encontrado que varios depsipéptidos muestran propiedades anticancerígenas.[4]​

Un inhibidor enzimático depsipeptídico incluye romidepsina, un miembro de la clase de péptidos bicíclicos, un conocido inhibidor de la histona deacetilasa (HDACi). Se aisló primero como un producto de la fermentación a partir de Chromobacterium violaceum por la compañía farmacéutica Fujisawa.[5]​

Datos preliminares mostraron en 2010 que el antibiótico Etamycin tenía una potente actividad contra SARM en un modelo de ratón.[6]​ Varios depsipéptidos procedentes de Streptomyces muestran actividad antimicrobiana.[7]​[8]​ Estos forman una nueva clase de antibióticos potenciales conocidos como acildepsipéptidos (ADEPs). Los ADEPs tienen como diana y activan la proteasa caseinolítica (ClpP) para iniciar la degradación descontrolada de péptidos y proteínas no plegadas, matando muchas bacterias grampositivas.[9]​[10]​[11]​

Lecturas adicionales

• Largazole: Poli, G.; DiFabio, R.; Ferrante, L.; Summa, V.; Botta, M. (2017). «Largazole Analogues as Histone Deacetylase Inhibitors and Anticancer Agents: An Overview of Structure–Activity Relationships». ChemMedChem 12 (23): 1917-1926. 
• papuamide: Ford, RJ; Gustafson, KR.; McKee, TC; Shigematsu, N.; Maurizi, LK.; Pannell, LK; Williams, DE; de Silva, ED; Lassota, P; Allen, TM; Van Soest, R; Andersen; Boyd, MR (1999). «Papuamides A-D, HIV-Inhibitory and Cytotoxic Depsipeptides from the Sponges Theonella mirabilis and Theonella swinhoei Collected in Papua New Guinea». J. Am. Chem. Soc. 121: 5899-5909. doi:10.1021/ja990582o. 
• neamphamide A: Oku, N; Gustafson, KR; Cartner, LK; Wilson, JA; Shigematsu, N; Hess, S; Pannell, LK; Boyd, MR et al. (2004). «Neamphamide A. A new HIV-inhibitory depsipeptide from the Papua New Guinea marine sponge Neamphius huxleyi». J. Nat. Prod. 67 (8): 1407-1411. PMID 15332865. doi:10.1021/np040003f.  Se sugiere usar |número-autores= (ayuda)
• callipeltin A: Zampella, A; D'Auria, MV; Paloma, LG; Casapullo, A; Minale, L; Debitus, C; Henin, Y (1996). «Callipeltin A, an Anti-HIV Cyclic Depsipeptide from the New Caledonian Lithistida Sponge Callipelta sp.». J. Am. Chem. Soc. 118: 6202-9. doi:10.1021/ja954287p. 
• mirabamides A-D: Plaza, A.; Gustchina, E; Baker, HL; Kelly, M; Bewley, CA (2007). «Mirabamides A-D. Depsipeptides from the sponge Siliquariaspongia mirabilis that inhibit HIV-1 fusion». J. Nat. Prod. 70 (11): 1753-60. PMID 17963357. doi:10.1021/np070306k. ; Andjelic, CD; Planelles, V; Barrows, LR (2008). «Characterizing the Anti-HIV Activity of Papuamide A.». Mar Drugs 6 (4): 528-549. PMC 2630844. PMID 19172193. doi:10.3390/md20080027. 

Referencias

1. Unión Internacional de Química Pura y Aplicada. «depsipeptides». Compendium of Chemical Terminology. Versión en línea (en inglés).
2. Yasumasa Hamada, Takayuki Shioiri (2005). «Recent Progress of the Synthetic Studies of Biologically Active Marine Cyclic Peptides and Depsipeptides». Chem. Rev. 105: 4441-4482. doi:10.1021/cr0406312. 
3. Walsh, Christopher T., Jun Liu, Frank Rusnak, and Masahiro Sakaitani (1990). «Molecular Studies on Enzymes in Chorismate Metabolism and the Enterobactin Biosynthetic Pathway». Chemical Reviews 90 (7): 1105-1129. doi:10.1021/cr00105a003. 
4. Kitagaki, J.; Shi, G.; Miyauchi, S.; Murakami, S.; Yang, Y. (2015). «Cyclic depsipeptides as potential cancer therapeutics». Anticancer Drugs 26: 259-71. PMID 25419631. doi:10.1097/CAD.0000000000000183. 
5. Yurek-George, Alexander; Cecil, Alexander Richard Liam; Mo, Alex Hon Kit; Wen, Shijun; Rogers, Helen; Habens, Fay; Maeda, Satoko; Yoshida, Minoru et al. (2007). «The First Biologically Active Synthetic Analogues of FK228, the Depsipeptide Histone Deacetylase Inhibitor». Journal of Medicinal Chemistry 50 (23): 5720-5726. PMID 17958342. doi:10.1021/jm0703800. 
6. Haste, Nina M; Perera, Varahenage R.; Maloney, Katherine N.; Tran, Dan N; Jensen, Paul; Fenical, William; Nizet, Victor; Hensler, Mary E (2010). «Activity of the streptogramin antibiotic etamycin against methicillin-resistant Staphylococcus aureus». Journal of Antibiotics 63 (5): 219. PMC 2889693. PMID 20339399. doi:10.1038/ja.2010.22. 
7. K. H. Michel, R. E. Kastner (Eli Lilly and Company), US 4492650, 1985 [Chem. Abstr. 1985, 102, 130459]
8. Osada, Hiroyuki; Yano, Tatsuya; Koshino, Hiroyuki; Isono, Kiyoshi (1991). «Enopeptin A, a novel depsipeptide antibiotic with anti-bacteriophage activity». The Journal of Antibiotics 44 (12): 1463-1466. doi:10.7164/antibiotics.44.1463. 
9. Li; Him Shun, Dominic; Guarné, Alba; Maurizi, Michael R.; Cheng, Yi-Qiang; Wright, Gerard D.; Ghirlando, Rodolfo; Joseph, Ebenezer; Gloyd, Melanie; Seon Chung, Yu; Ortega, Joaquin (2010). «Acyldepsipeptide Antibiotics Induce The Formation Of A Structured Axial Channel In ClpP: A Model For The ClpX/ClpA-Bound State Of ClpP». Chemistry & Biology 17 (9): 959-969. PMC 2955292. PMID 20851345. doi:10.1016/j.chembiol.2010.07.008. 
10. Hinzen, Berthold; Labischinski, Harald; Brötz-Oesterhelt, Heike; Endermann, Rainer; Benet-Buchholz, Jordi; Hellwig, Veronica; Häbich, Dieter; Schumacher, Andreas; Lampe, Thomas; Paulsen, Holger; Raddatz, Siegfried (2006). «Medicinal Chemistry Optimization of Acyldepsipeptides of the Enopeptin Class Antibiotics». ChemMedChem 1 (7): 689-693. PMID 16902918. doi:10.1002/cmdc.200600055. 
11. Carney, Daniel W.; Schmitz, Karl R.; Truong, Jonathan V.; Sauer, Robert T.; Sello, Jason K. (2014). «Restriction of the Conformational Dynamics of the Cyclic Acyldepsipeptide Antibiotics Improves Their Antibacterial Activity». JACS 136: 1922-1929. doi:10.1021/ja410385c. 

• Datos: Q413248
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